More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1224 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  100 
 
 		 745 aa  1511    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  53.76 
 
 		 776 aa  139  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  54.09 
 
 		 277 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  44.92 
 
 		 286 aa  130  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  45.96 
 
 		 234 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  44.39 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  45.13 
 
 		 216 aa  127  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  46.33 
 
 		 213 aa  127  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  43.2 
 
 		 381 aa  126  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  53.85 
 
 		 1033 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  42.23 
 
 		 517 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 		 567 aa  124  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  46.43 
 
 		 225 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  44.28 
 
 		 493 aa  122  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  48.12 
 
 		 351 aa  120  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  46.88 
 
 		 386 aa  120  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  44.21 
 
 		 309 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1082  pentapeptide protein  50 
 
 		 614 aa  118  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  43.52 
 
 		 278 aa  117  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 319 aa  117  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  41.07 
 
 		 521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  43.72 
 
 		 489 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  45.76 
 
 		 449 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  47.78 
 
 		 416 aa  115  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  40.91 
 
 		 332 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  39.9 
 
 		 266 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  37.93 
 
 		 333 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  50.67 
 
 		 903 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  46.6 
 
 		 320 aa  111  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  37.19 
 
 		 294 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  49.38 
 
 		 184 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  39.38 
 
 		 273 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  37.1 
 
 		 862 aa  108  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  37.66 
 
 		 268 aa  108  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  44.59 
 
 		 219 aa  108  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  44.26 
 
 		 264 aa  107  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  46.21 
 
 		 182 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  44.94 
 
 		 189 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  40.76 
 
 		 401 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  40.76 
 
 		 401 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  37.31 
 
 		 366 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  46.47 
 
 		 343 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  37.93 
 
 		 241 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  46.47 
 
 		 343 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  39.79 
 
 		 576 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  41.97 
 
 		 441 aa  103  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  40.12 
 
 		 215 aa  103  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  36.98 
 
 		 350 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  43.56 
 
 		 291 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  46.41 
 
 		 184 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  40.96 
 
 		 401 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  40.25 
 
 		 215 aa  101  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  48.85 
 
 		 234 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  48.85 
 
 		 234 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  43.56 
 
 		 291 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  37.87 
 
 		 389 aa  101  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  43.29 
 
 		 340 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  50.43 
 
 		 900 aa  100  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  50.78 
 
 		 973 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  40.43 
 
 		 401 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  35.2 
 
 		 366 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  44.37 
 
 		 182 aa  99.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  34.91 
 
 		 295 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  48.55 
 
 		 447 aa  98.2  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  44.16 
 
 		 493 aa  98.6  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  40.7 
 
 		 336 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  40.7 
 
 		 336 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  40.76 
 
 		 311 aa  98.2  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  40.62 
 
 		 446 aa  97.8  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  43.71 
 
 		 245 aa  97.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  44.58 
 
 		 433 aa  97.4  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  48.47 
 
 		 299 aa  97.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  42.24 
 
 		 263 aa  96.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  41.48 
 
 		 199 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  43.4 
 
 		 199 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  37.44 
 
 		 734 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  36.23 
 
 		 250 aa  95.5  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  48.47 
 
 		 237 aa  95.9  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  43.95 
 
 		 176 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  46.72 
 
 		 412 aa  95.5  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  43.95 
 
 		 176 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  45.95 
 
 		 279 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  45.95 
 
 		 279 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  40.26 
 
 		 225 aa  95.1  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.91 
 
 		 525 aa  94.7  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 448 aa  94.7  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  35.71 
 
 		 366 aa  94.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  35.71 
 
 		 366 aa  94.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  43.84 
 
 		 384 aa  94  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 260 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  42.94 
 
 		 381 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 442 aa  93.2  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  37.14 
 
 		 450 aa  93.2  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  36.8 
 
 		 262 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  43.1 
 
 		 204 aa  93.2  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  45.86 
 
 		 190 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  34.16 
 
 		 1191 aa  92.4  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  41.34 
 
 		 267 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  40.36 
 
 		 219 aa  92  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  35.68 
 
 		 706 aa  92  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>