More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0149 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0149  NusG antitermination factor  100 
 
 		 197 aa  394  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.114969  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0626  NusG antitermination factor  70.21 
 
 		 196 aa  266  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000497813  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1589  NusG antitermination factor  73.3 
 
 		 184 aa  259  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262291  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1665  NusG antitermination factor  73.65 
 
 		 170 aa  256  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2594  transcription antitermination protein nusG  71.95 
 
 		 180 aa  254  7e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000665583  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0965  NusG antitermination factor  58.9 
 
 		 169 aa  206  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1511  NusG antitermination factor  62.11 
 
 		 172 aa  201  5e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3892  NGN domain protein  38.69 
 
 		 176 aa  121  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0546  NGN domain protein  34.15 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2360  NusG antitermination factor  36.81 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00889306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3605  NusG antitermination factor  31.68 
 
 		 174 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  hitchhiker  0.000423635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5198  NusG antitermination factor  30 
 
 		 170 aa  92.8  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.296838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0357  NusG antitermination factor  30.82 
 
 		 154 aa  90.5  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0887  transcription antitermination protein nusG  30.67 
 
 		 182 aa  88.6  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.769632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3498  transcription antitermination protein nusG  32.94 
 
 		 194 aa  85.1  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1699  NusG antitermination factor  29.94 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6306  NusG antitermination factor  31.91 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.343168 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2803  NusG antitermination factor  29.68 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2660  NusG antitermination factor  29.75 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192124  normal  0.041125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  34.07 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5306  NusG antitermination factor  28.1 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955236  normal  0.0968328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  33.91 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  33.53 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2844  NusG antitermination factor  28 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.117724  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2894  transcriptional acivator RfaH  27.85 
 
 		 168 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000245267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  34.78 
 
 		 175 aa  70.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3036  transcriptional acivator RfaH  26.58 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00758207  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  32.86 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2904  transcriptional acivator RfaH  26.45 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160957  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2812  transcription antitermination protein nusG  26.72 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1469  transcriptional acivator RfaH  26.45 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000410204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1374  transcription antitermination protein nusG  27.22 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000814975  hitchhiker  0.00000420235 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194  transcriptional activator rfaH, putative  26.58 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3398  NusG antitermination factor  20.48 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191132  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1314  transcription antitermination protein nusG  27.52 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0397005  normal  0.368263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1381  transcription antitermination protein nusG  27.52 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111282  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  30.46 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1650  transcriptional acivator RfaH  26.92 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0204524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3466  NusG antitermination factor  27.27 
 
 		 169 aa  67  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  33.1 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  33.1 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3451  NusG antitermination factor  31.13 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0281776  normal  0.0124295 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  34.29 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  32.39 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  32.41 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  31.25 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3638  NusG antitermination factor  24.71 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  31.69 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  29.03 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2544  NusG antitermination factor  25.32 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1394  transcriptional acivator RfaH  26.9 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0133861  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  35 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  35 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  32.14 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  31.69 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  31.69 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  31.69 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  31.69 
 
 		 177 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0744  transcription antitermination protein NusG  33.11 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000594191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  29.73 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  31.69 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  31.69 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01331  transcriptional activator RfaH  27.39 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  29.94 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  30.99 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  31.21 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  30.99 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  32.18 
 
 		 174 aa  61.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  31.21 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  31.21 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1041  NusG antitermination factor  31.17 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0043552  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2672  transcriptional activator RfaH  24.85 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000489964  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  30.06 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  30.06 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3134  NusG antitermination factor  25.25 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  31.21 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0826  transcriptional activator RfaH  26.28 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2551  transcription antitermination protein NusG  30.19 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000171979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2265  NusG antitermination factor  25.32 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0409  transcription antitermination protein NusG  29.58 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00119754  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  28.37 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2265  transcriptional activator rfaH, putative  25.81 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000106043  hitchhiker  0.00695369 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  30.05 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  31.69 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0227  transcription antitermination protein nusG  28.86 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.355469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  30.71 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  32.22 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1422  transcription antitermination protein nusG  32.72 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.002098  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  30.71 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0643  NusG antitermination factor  31.17 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  29.08 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  30.29 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  29.08 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  28.37 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  29.07 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1398  NusG antitermination factor  26.51 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000128095  normal  0.158725 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  31.54 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  31.03 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4288  NusG antitermination factor  33.1 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000127222  hitchhiker  0.00000238714 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  28.06 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>