More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5809 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  100 
 
 		 578 aa  1154    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.34 
 
 		 596 aa  326  6e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  40.67 
 
 		 604 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  36.89 
 
 		 609 aa  293  6e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  34.39 
 
 		 604 aa  289  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1277  ABC transporter related protein  36.76 
 
 		 590 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  37.1 
 
 		 616 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  32.5 
 
 		 611 aa  270  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1839  ABC transporter related protein  40.55 
 
 		 590 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298926  normal  0.0982891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  35.47 
 
 		 623 aa  264  4e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  36.62 
 
 		 625 aa  263  6.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  36.35 
 
 		 621 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  34.8 
 
 		 603 aa  258  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  35.47 
 
 		 621 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  35.47 
 
 		 621 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  36.87 
 
 		 625 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.76 
 
 		 603 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  32.37 
 
 		 614 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  38.63 
 
 		 615 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  36.09 
 
 		 619 aa  252  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  33.58 
 
 		 618 aa  248  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  35.77 
 
 		 626 aa  248  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  33.39 
 
 		 618 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  36.29 
 
 		 623 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  38.48 
 
 		 638 aa  243  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  31.92 
 
 		 611 aa  243  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  37.9 
 
 		 618 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  39.61 
 
 		 615 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  35.67 
 
 		 625 aa  240  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  38.04 
 
 		 633 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  34.07 
 
 		 621 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  32.34 
 
 		 592 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  34.47 
 
 		 608 aa  233  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  36.15 
 
 		 595 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.37 
 
 		 600 aa  225  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  35.76 
 
 		 616 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  35.77 
 
 		 613 aa  218  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  32.8 
 
 		 626 aa  216  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  31.63 
 
 		 611 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  35.62 
 
 		 626 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  31.29 
 
 		 608 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  32.94 
 
 		 619 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  34.28 
 
 		 618 aa  215  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  33.21 
 
 		 627 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  30.34 
 
 		 613 aa  211  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  39.29 
 
 		 606 aa  211  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  44.36 
 
 		 611 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  31.42 
 
 		 605 aa  206  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43 
 
 		 633 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  26.92 
 
 		 597 aa  204  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  43.58 
 
 		 617 aa  202  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  37.89 
 
 		 599 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  34.92 
 
 		 608 aa  202  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  36.43 
 
 		 647 aa  200  7.999999999999999e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  42.48 
 
 		 662 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  27.48 
 
 		 566 aa  197  5.000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.42 
 
 		 587 aa  196  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  35.7 
 
 		 623 aa  194  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  45.05 
 
 		 500 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  31.58 
 
 		 619 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  33.74 
 
 		 673 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  25.6 
 
 		 591 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  31.82 
 
 		 619 aa  188  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.98 
 
 		 600 aa  187  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  32.55 
 
 		 616 aa  187  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  30.69 
 
 		 596 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  39.68 
 
 		 631 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  26.99 
 
 		 606 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.54 
 
 		 579 aa  183  9.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  38.51 
 
 		 746 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  27.87 
 
 		 605 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.94 
 
 		 590 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  36.36 
 
 		 591 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.29 
 
 		 597 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1719  ABC transporter related  30.16 
 
 		 631 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.737168  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  31.46 
 
 		 618 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  27.55 
 
 		 624 aa  180  5.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.81 
 
 		 614 aa  179  8e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  42.53 
 
 		 579 aa  179  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  37.84 
 
 		 610 aa  179  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0185  ABC transporter ATP-binding protein  33.23 
 
 		 585 aa  179  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4984  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.85 
 
 		 624 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  31.63 
 
 		 603 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1395  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  41.22 
 
 		 610 aa  178  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.507365  hitchhiker  0.000128889 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  34.8 
 
 		 584 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  25.65 
 
 		 603 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0536  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  29.83 
 
 		 600 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.742929 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1316  lipid/multidrug ABC transporter MsbA ATPase and inner membrane domains  35.58 
 
 		 595 aa  176  7e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0184  ABC transporter, ATP-binding protein  27.24 
 
 		 586 aa  176  8e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  27.92 
 
 		 594 aa  176  8e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  30.45 
 
 		 601 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.34 
 
 		 587 aa  176  9e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  33.58 
 
 		 603 aa  176  9e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  38.15 
 
 		 609 aa  176  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.29 
 
 		 587 aa  176  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4878  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 991 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.360645  normal  0.0233171 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3801  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 981 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  30.45 
 
 		 601 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.78 
 
 		 594 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  39.85 
 
 		 626 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>