More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0350 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
541 aa  1093    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  48.73 
 
 
551 aa  499  1e-140  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  43.64 
 
 
575 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  45.41 
 
 
582 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  44.58 
 
 
581 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  42.93 
 
 
578 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  43.42 
 
 
594 aa  472  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  44.94 
 
 
585 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  44.09 
 
 
578 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  44.09 
 
 
578 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  44.09 
 
 
578 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 
578 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  44.35 
 
 
580 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  44.09 
 
 
578 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  43.79 
 
 
579 aa  466  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 
578 aa  467  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  43.92 
 
 
578 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 
578 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 
578 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  43.99 
 
 
576 aa  464  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  41.61 
 
 
590 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 
578 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  43.09 
 
 
580 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 
578 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  43.09 
 
 
580 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 
578 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  44.89 
 
 
576 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  41.52 
 
 
583 aa  456  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  40.93 
 
 
590 aa  455  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  42.12 
 
 
582 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  42.38 
 
 
585 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 
578 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  43.09 
 
 
580 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 
578 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  42.93 
 
 
580 aa  449  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  43.11 
 
 
580 aa  448  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  41.05 
 
 
579 aa  426  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  39.78 
 
 
592 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  39.78 
 
 
592 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  39.48 
 
 
599 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  38.56 
 
 
617 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  39.42 
 
 
510 aa  403  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  37.75 
 
 
588 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  38.87 
 
 
512 aa  402  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  40.73 
 
 
583 aa  401  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  37.77 
 
 
578 aa  393  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  37.3 
 
 
593 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  39.28 
 
 
589 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  37.74 
 
 
593 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  36.38 
 
 
587 aa  385  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  36.61 
 
 
1106 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  38.26 
 
 
599 aa  377  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  36.67 
 
 
667 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  35.93 
 
 
913 aa  360  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  35.93 
 
 
913 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  35.75 
 
 
913 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  35.93 
 
 
913 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  35.58 
 
 
921 aa  357  3.9999999999999996e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  35.15 
 
 
943 aa  356  5e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  35.77 
 
 
911 aa  356  5.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  35.77 
 
 
911 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  35.77 
 
 
911 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  35.77 
 
 
911 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  35.77 
 
 
911 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  35.77 
 
 
911 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  35.77 
 
 
911 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  35.77 
 
 
911 aa  355  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  35.58 
 
 
911 aa  354  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  35.57 
 
 
994 aa  351  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  37.82 
 
 
912 aa  348  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.6 
 
 
913 aa  345  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  34.92 
 
 
909 aa  342  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  33.82 
 
 
901 aa  341  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  35.48 
 
 
908 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  35.51 
 
 
927 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  35.22 
 
 
920 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  35.19 
 
 
922 aa  339  7e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  33.09 
 
 
914 aa  338  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  34.06 
 
 
912 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  33.88 
 
 
912 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  34.43 
 
 
926 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  32.55 
 
 
922 aa  337  3.9999999999999995e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  35.21 
 
 
904 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  35.25 
 
 
651 aa  335  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  35.36 
 
 
929 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.37 
 
 
914 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  34.07 
 
 
936 aa  333  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  33.88 
 
 
912 aa  334  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  33.63 
 
 
933 aa  333  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  34.43 
 
 
1017 aa  333  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  34.07 
 
 
936 aa  333  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  35.66 
 
 
921 aa  333  5e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  33.82 
 
 
918 aa  333  6e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  33.57 
 
 
930 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  34.54 
 
 
932 aa  332  9e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  34.36 
 
 
924 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  35.53 
 
 
919 aa  332  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  34.97 
 
 
901 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.82 
 
 
907 aa  331  3e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  34.97 
 
 
927 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>