More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_2054 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  100 
 
 
332 aa  684    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  98.77 
 
 
326 aa  664    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1719  secretion protein HlyD  37.58 
 
 
315 aa  196  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0706497  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4329  secretion protein HlyD family protein  40.73 
 
 
327 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0052  secretion protein HlyD family protein  38.8 
 
 
324 aa  185  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0055  secretion protein HlyD family protein  38.46 
 
 
324 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1084  HlyD family secretion protein  38.64 
 
 
356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  36.12 
 
 
359 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0163  lipoprotein  38.54 
 
 
311 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0904469  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3452  HlyD family secretion protein  35.23 
 
 
326 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349475  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  37.54 
 
 
344 aa  180  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1744  HlyD family secretion protein  38.46 
 
 
321 aa  179  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0223446  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0409  secretion protein HlyD  37 
 
 
332 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0350  secretion protein HlyD  35.81 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3691  secretion protein HlyD family protein  37.95 
 
 
320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4164  secretion protein HlyD family protein  37.95 
 
 
320 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571077  normal  0.349969 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  34.31 
 
 
314 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  33.33 
 
 
314 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  33.01 
 
 
314 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1342  HlyD family secretion protein  29.45 
 
 
317 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2707  secretion protein HlyD family protein  35.27 
 
 
328 aa  129  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0650452  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0717  hypothetical protein  28.76 
 
 
257 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369321  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  28.52 
 
 
263 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4665  secretion protein HlyD family protein  33.67 
 
 
328 aa  122  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267783  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  28.1 
 
 
267 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  26.79 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5305  hypothetical protein  29.32 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.141224 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2440  secretion protein HlyD family protein  28.12 
 
 
265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.41732 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1035  secretion protein HlyD  32.53 
 
 
324 aa  109  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.833081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  28.67 
 
 
329 aa  109  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  29.33 
 
 
335 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  27.18 
 
 
331 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  27.01 
 
 
316 aa  106  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0506  secretion protein HlyD family protein  30.5 
 
 
317 aa  105  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  27.8 
 
 
328 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  28.43 
 
 
326 aa  103  4e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  26.76 
 
 
331 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5057  secretion protein HlyD family protein  33.01 
 
 
313 aa  102  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  27.15 
 
 
329 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  26.73 
 
 
331 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  28.67 
 
 
323 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  26.73 
 
 
331 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  26.73 
 
 
331 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  26.73 
 
 
331 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  26.73 
 
 
331 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  26.6 
 
 
323 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  30.54 
 
 
355 aa  99  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4361  secretion protein HlyD family protein  26.71 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  26.6 
 
 
323 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  29.71 
 
 
332 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1250  hypothetical protein  26.05 
 
 
322 aa  96.7  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  27 
 
 
354 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  24.64 
 
 
357 aa  94.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  27.7 
 
 
328 aa  92.8  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  28.47 
 
 
344 aa  92.8  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  27.7 
 
 
328 aa  92.8  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  27.24 
 
 
335 aa  91.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  24.38 
 
 
357 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  29.39 
 
 
308 aa  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  26.91 
 
 
355 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  27.85 
 
 
333 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0427  hypothetical protein  28.53 
 
 
317 aa  90.9  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  25.66 
 
 
467 aa  90.1  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  27.69 
 
 
342 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  27.12 
 
 
342 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  24.53 
 
 
349 aa  89.7  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  27.6 
 
 
339 aa  89.7  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  27.49 
 
 
333 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  29.47 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0093  HlyD family secretion protein  26.33 
 
 
331 aa  87.8  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0320304 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  26.07 
 
 
334 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2833  secretion protein HlyD family protein  29.8 
 
 
383 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121026  normal  0.828234 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  25.74 
 
 
331 aa  87  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  26.25 
 
 
315 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.316135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  25.74 
 
 
332 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  25.74 
 
 
331 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  25.74 
 
 
331 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  27.52 
 
 
371 aa  86.7  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  25.74 
 
 
332 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  26.8 
 
 
328 aa  86.7  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  25.74 
 
 
331 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  25.74 
 
 
331 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  26.64 
 
 
354 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1420  secretion protein HlyD family protein  30.43 
 
 
332 aa  86.3  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  25.74 
 
 
331 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  26.65 
 
 
407 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0587  hypothetical protein  25.8 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654708  hitchhiker  0.0000117707 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  25.42 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  25.09 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  25.27 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  26.94 
 
 
320 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  23.24 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0396  secretion protein HlyD family protein  26.57 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1513  secretion protein HlyD family protein  29.29 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  27.65 
 
 
281 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  28.12 
 
 
357 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  26.1 
 
 
331 aa  84  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  26.85 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  26.73 
 
 
413 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>