More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03975 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03975  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
440 aa  895    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419536  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0482  peptidase M50  57.92 
 
 
442 aa  531  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0205055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2050  peptidase M50  49.67 
 
 
444 aa  431  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0906941  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1159  peptidase M50  49.22 
 
 
447 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0383  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  42.76 
 
 
439 aa  351  2e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  41.11 
 
 
430 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  40.95 
 
 
444 aa  318  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  38.81 
 
 
438 aa  303  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4131  membrane-associated zinc metalloprotease  39 
 
 
438 aa  286  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0469  hypothetical protein  36.56 
 
 
438 aa  271  2e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  31.98 
 
 
453 aa  206  6e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0076  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.11 
 
 
454 aa  205  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  31.75 
 
 
469 aa  205  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  32.21 
 
 
453 aa  203  5e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  32.51 
 
 
453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  33.85 
 
 
453 aa  196  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000512767  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.76 
 
 
453 aa  194  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2681  peptidase RseP  31.74 
 
 
446 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  29.33 
 
 
439 aa  164  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.87 
 
 
441 aa  160  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  27.75 
 
 
446 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  27.37 
 
 
494 aa  143  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  25.9 
 
 
452 aa  142  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.88 
 
 
455 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.62 
 
 
450 aa  137  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  26.52 
 
 
438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.39 
 
 
457 aa  127  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.82 
 
 
446 aa  128  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  26.82 
 
 
457 aa  127  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  27.23 
 
 
452 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.16 
 
 
455 aa  125  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  26.06 
 
 
452 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  26.86 
 
 
428 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  26.67 
 
 
463 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2341  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.33 
 
 
450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00281256  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  24.22 
 
 
466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  27.63 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.3 
 
 
451 aa  119  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.3 
 
 
458 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.84 
 
 
462 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  26.85 
 
 
461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  25.86 
 
 
454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.97 
 
 
456 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  24.63 
 
 
451 aa  117  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.41 
 
 
455 aa  117  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1442  peptidase RseP  24.78 
 
 
463 aa  117  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000104376 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  24.52 
 
 
462 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  26.39 
 
 
452 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.11 
 
 
444 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  24.47 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  24.47 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  25.97 
 
 
452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.64 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  24.47 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  23.55 
 
 
456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  23.91 
 
 
469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  24.47 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  24.47 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  26.64 
 
 
456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  24.35 
 
 
454 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  24.47 
 
 
450 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.37 
 
 
449 aa  113  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.98 
 
 
456 aa  113  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  25.79 
 
 
461 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  24.26 
 
 
450 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  25.16 
 
 
462 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.36 
 
 
455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  24.26 
 
 
450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1409  peptidase RseP  23.67 
 
 
450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139701 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  27.11 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.58 
 
 
450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.71 
 
 
456 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  25.93 
 
 
456 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.21 
 
 
480 aa  111  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  23.67 
 
 
450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.23 
 
 
361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.85 
 
 
456 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  24.04 
 
 
450 aa  110  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  25.49 
 
 
456 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.77 
 
 
454 aa  110  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.534623  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  24.69 
 
 
452 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  24.3 
 
 
450 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  24.3 
 
 
450 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  24.3 
 
 
450 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  25.32 
 
 
461 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  24.3 
 
 
450 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1797  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.74 
 
 
479 aa  108  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.88903  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  24.3 
 
 
450 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  24.52 
 
 
450 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.83 
 
 
456 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  26.71 
 
 
454 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  22.81 
 
 
457 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  22.81 
 
 
457 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  22.81 
 
 
457 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  25.49 
 
 
456 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.79 
 
 
450 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.47 
 
 
448 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  24.2 
 
 
463 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  23.72 
 
 
450 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  24.18 
 
 
453 aa  106  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>