More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4513 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  680    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  47.32 
 
 		 327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4614  hypothetical protein  49.83 
 
 		 322 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.44 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  44.74 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  48.86 
 
 		 328 aa  278  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  45.92 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  47.47 
 
 		 326 aa  275  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  45.45 
 
 		 331 aa  275  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  42.52 
 
 		 344 aa  275  7e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  46.71 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  44.94 
 
 		 333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  46.28 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  45.54 
 
 		 325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  46.2 
 
 		 332 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  44.37 
 
 		 314 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  46.67 
 
 		 320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  44.88 
 
 		 360 aa  269  5e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  45.99 
 
 		 353 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  45.64 
 
 		 325 aa  268  7e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  45.54 
 
 		 345 aa  268  8e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  45.54 
 
 		 345 aa  268  8e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  45.77 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  46.62 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  41.54 
 
 		 334 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  46.42 
 
 		 330 aa  266  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  46.42 
 
 		 330 aa  266  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  45.85 
 
 		 333 aa  265  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  43.15 
 
 		 323 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  42.86 
 
 		 318 aa  262  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  40.18 
 
 		 331 aa  262  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  44.05 
 
 		 328 aa  262  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  43.73 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  43.96 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  45.27 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  43.73 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  44.82 
 
 		 339 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  44.59 
 
 		 322 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  44.71 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  44.78 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  42.57 
 
 		 321 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  43.79 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  41.89 
 
 		 337 aa  256  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  43.43 
 
 		 341 aa  256  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40.06 
 
 		 336 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  41.23 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  43.14 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  39.94 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  45 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  40.3 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  41.18 
 
 		 330 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  44.41 
 
 		 330 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0715  hypothetical protein  45.73 
 
 		 323 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.771056 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  42.43 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.69 
 
 		 325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  40.84 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  46.08 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  39.81 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  42.76 
 
 		 335 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  42.39 
 
 		 332 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.79 
 
 		 323 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  40 
 
 		 330 aa  252  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  43.92 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  43.52 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  43.84 
 
 		 339 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  42.32 
 
 		 333 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  42.9 
 
 		 327 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  42.86 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  41.23 
 
 		 325 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  41.62 
 
 		 339 aa  248  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  43.12 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  43 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.21 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6157  hypothetical protein  44.63 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  43.29 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  43.43 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  41.35 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  39.64 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  41.28 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  42.49 
 
 		 324 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  44.65 
 
 		 322 aa  246  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  40.54 
 
 		 334 aa  246  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  44.48 
 
 		 322 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  44.67 
 
 		 324 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  40.79 
 
 		 329 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  40.59 
 
 		 327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  40.36 
 
 		 330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1513  hypothetical protein  40.27 
 
 		 337 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.283946  normal  0.153712 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  42.62 
 
 		 329 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  43.51 
 
 		 326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  43.3 
 
 		 325 aa  246  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2537  hypothetical protein  40.23 
 
 		 329 aa  245  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  40.75 
 
 		 343 aa  245  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  41.64 
 
 		 349 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  41.27 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  41.28 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  42.42 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  40.72 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  40.6 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.81 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>