More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3942 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 385 aa  767    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  70.88 
 
 		 377 aa  519  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  68.83 
 
 		 376 aa  504  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  69.32 
 
 		 384 aa  478  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  62.16 
 
 		 394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  59.95 
 
 		 378 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  61.3 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  58.31 
 
 		 383 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  58.31 
 
 		 383 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  58.65 
 
 		 380 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  58.81 
 
 		 375 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  56.18 
 
 		 378 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  55.8 
 
 		 383 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  59.08 
 
 		 375 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  57.87 
 
 		 382 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  57.98 
 
 		 382 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  57.48 
 
 		 383 aa  322  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  46.58 
 
 		 389 aa  322  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  48.66 
 
 		 378 aa  317  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  43.47 
 
 		 394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  44.8 
 
 		 389 aa  305  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  44.15 
 
 		 376 aa  300  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  46.39 
 
 		 391 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  46.36 
 
 		 394 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  44.85 
 
 		 389 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  47.06 
 
 		 384 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  46.81 
 
 		 389 aa  288  9e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  37.9 
 
 		 385 aa  233  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  38.27 
 
 		 388 aa  232  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  37.27 
 
 		 393 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  37.2 
 
 		 386 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  36.68 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  35.39 
 
 		 390 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  35.39 
 
 		 390 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  33.06 
 
 		 376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 373 aa  159  6e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 984 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 983 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 		 960 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  32.06 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 387 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 392 aa  138  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 		 492 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 383 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 446 aa  132  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  31.81 
 
 		 500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 		 496 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 500 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 382 aa  129  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 389 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 389 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  27.82 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 441 aa  124  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 441 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 444 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 444 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  27.08 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  28.61 
 
 		 442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  28.61 
 
 		 442 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 442 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  28.61 
 
 		 442 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 442 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  28.61 
 
 		 442 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 442 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  26.92 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  27.78 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  28.61 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 441 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 441 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 441 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 823 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 444 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  42.51 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 393 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.95 
 
 		 378 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  27.11 
 
 		 369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>