More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1161 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  637    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  49.67 
 
 		 330 aa  295  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  45.85 
 
 		 325 aa  293  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  47.85 
 
 		 324 aa  293  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  46.89 
 
 		 321 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  44.63 
 
 		 330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  44.82 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  44.82 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  46.64 
 
 		 342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  45.6 
 
 		 325 aa  281  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  45.97 
 
 		 328 aa  281  9e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  44.56 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  45.79 
 
 		 331 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  44.2 
 
 		 323 aa  279  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  47.81 
 
 		 327 aa  278  8e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  46.11 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  47.1 
 
 		 349 aa  276  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  44.06 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  44.48 
 
 		 337 aa  275  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  43.48 
 
 		 325 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  45.6 
 
 		 331 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  46.86 
 
 		 335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.52 
 
 		 330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  45.76 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44.85 
 
 		 327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  44 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  47.49 
 
 		 328 aa  271  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  45.21 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  44.26 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  45.3 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  45.3 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  43.56 
 
 		 333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  46.64 
 
 		 304 aa  270  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.37 
 
 		 339 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  44.85 
 
 		 327 aa  269  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  45.79 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  44.33 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  44.97 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  47.32 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  45.79 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  43.43 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  47.78 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  46.62 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3599  hypothetical protein  48.48 
 
 		 343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.373831  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  43.62 
 
 		 356 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  42.76 
 
 		 326 aa  266  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  46.05 
 
 		 339 aa  265  5.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  46.44 
 
 		 322 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  42.72 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  46.96 
 
 		 331 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  40.31 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  45.85 
 
 		 338 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  43.85 
 
 		 322 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  45.33 
 
 		 322 aa  262  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  42.59 
 
 		 324 aa  262  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.44 
 
 		 326 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  44.37 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  43.56 
 
 		 332 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.97 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  46.44 
 
 		 332 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  43.39 
 
 		 338 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  44.3 
 
 		 330 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  44.44 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.52 
 
 		 331 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  45.92 
 
 		 335 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.45 
 
 		 323 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  43.85 
 
 		 335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  45.08 
 
 		 335 aa  258  9e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  44.52 
 
 		 339 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  43.81 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.8 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  45.33 
 
 		 323 aa  257  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  44.48 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  45.08 
 
 		 358 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1798  hypothetical protein  44.07 
 
 		 329 aa  256  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.379878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  44.9 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  39.82 
 
 		 334 aa  256  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  47.47 
 
 		 334 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  44.52 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  46.15 
 
 		 331 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  44.07 
 
 		 335 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  43.73 
 
 		 324 aa  255  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  40.46 
 
 		 332 aa  255  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  44.08 
 
 		 332 aa  255  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  42.33 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  42.52 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.8 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  42.43 
 
 		 314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.43 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  42.71 
 
 		 330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.4 
 
 		 328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  43.64 
 
 		 353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1997  hypothetical protein  47.02 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.02937  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  42.24 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  42.62 
 
 		 330 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.48 
 
 		 360 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  40 
 
 		 325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  40.58 
 
 		 330 aa  252  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  43.52 
 
 		 327 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  44.67 
 
 		 336 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>