129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5799 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5799  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 117 aa  237  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000000795451  normal  0.486664 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5789  transcriptional regulator, IclR family  77.23 
 
 		 268 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5796  IclR family transcriptional regulator  77.33 
 
 		 245 aa  120  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  33 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02910  IclR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 259 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186754 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 260 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  62  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2707  regulatory protein IclR  36.08 
 
 		 292 aa  62  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2426  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.172825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 260 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5781  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 271 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 261 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 262 aa  60.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2147  IclR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6106  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5704 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5724  transcriptional regulator, IclR family  36.17 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25.51 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  27.55 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2705  regulatory proteins, IclR  31.63 
 
 		 284 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  30.21 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  32.26 
 
 		 263 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0296  IclR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 260 aa  57  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  30.21 
 
 		 260 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4650  IclR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30240  IclR family regulatory protein  35.11 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  32.26 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4910  IclR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 258 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  21.43 
 
 		 257 aa  52.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  26.04 
 
 		 257 aa  52.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 267 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2088  transcriptional regulator, IclR family  30.21 
 
 		 273 aa  52  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3829  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 264 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 267 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 257 aa  50.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  32.29 
 
 		 251 aa  50.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3124  IclR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 258 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.845824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3242  IclR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 258 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524532 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4108  transcriptional regulator, IclR family  30.61 
 
 		 260 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  32 
 
 		 247 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5288  regulatory protein, IclR  26.67 
 
 		 278 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.497587 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 		 280 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 265 aa  47.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 268 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 261 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2601  IclR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 258 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0687199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  30.21 
 
 		 251 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 283 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 258 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 		 264 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4070  IclR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 274 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0906  transcriptional regulator, IclR family  47.54 
 
 		 272 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  27.08 
 
 		 254 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  27.84 
 
 		 255 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  31.52 
 
 		 287 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 259 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  31.52 
 
 		 278 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 272 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 260 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  30.93 
 
 		 267 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 295 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  26.04 
 
 		 259 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 256 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 261 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  36.59 
 
 		 268 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 291 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 252 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  36.59 
 
 		 269 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  26.09 
 
 		 275 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1546  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 260 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00070993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  27.08 
 
 		 254 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 267 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5126  transcriptional regulator, IclR family  32.63 
 
 		 255 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 260 aa  43.5  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  34.15 
 
 		 252 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3974  transcriptional regulator, IclR family  28.42 
 
 		 266 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.482822  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 249 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 249 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 263 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 249 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 278 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  28.57 
 
 		 265 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 272 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  34.44 
 
 		 249 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5886  transcriptional regulator, IclR family  34.15 
 
 		 252 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  25.51 
 
 		 249 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  25.51 
 
 		 249 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  28.12 
 
 		 269 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3648  transcriptional regulator, IclR family  29.47 
 
 		 263 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 249 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5311  regulatory protein, IclR  30 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2586  IclR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 325 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.556667  normal  0.947412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3216  IclR family transcriptional regulator  29 
 
 		 256 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  26.88 
 
 		 272 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  25.51 
 
 		 249 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  26.32 
 
 		 257 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  26.88 
 
 		 272 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2609  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 256 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  0.0160268 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 255 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>