More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4838 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4838  porin  100 
 
 		 385 aa  782    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000248162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  40.85 
 
 		 377 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  42.22 
 
 		 381 aa  288  9e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  43.52 
 
 		 383 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  40.93 
 
 		 386 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  42.08 
 
 		 414 aa  278  8e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  41.26 
 
 		 384 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  41.26 
 
 		 384 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  41.26 
 
 		 384 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  41.26 
 
 		 384 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  41.26 
 
 		 384 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  41.26 
 
 		 384 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  41.26 
 
 		 384 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  42.26 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  41.64 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  41.37 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  41.6 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  41.6 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  41.6 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  41.37 
 
 		 384 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  41.87 
 
 		 386 aa  269  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  38.7 
 
 		 383 aa  269  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  41.84 
 
 		 375 aa  268  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  39.39 
 
 		 394 aa  268  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  41.05 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  41.05 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  41.34 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  42.11 
 
 		 375 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  41.69 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  41.58 
 
 		 375 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  41.58 
 
 		 375 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  37.78 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  41.79 
 
 		 381 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  40.95 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  38.54 
 
 		 383 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  40.22 
 
 		 385 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  40.37 
 
 		 389 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  40.37 
 
 		 389 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  40.37 
 
 		 389 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  38.85 
 
 		 382 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  38.64 
 
 		 394 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  41.37 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  40.52 
 
 		 383 aa  253  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  40.92 
 
 		 381 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  41.53 
 
 		 379 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  41.83 
 
 		 375 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  38.58 
 
 		 391 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  38.76 
 
 		 384 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  40.46 
 
 		 386 aa  246  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  40.46 
 
 		 383 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  41.1 
 
 		 386 aa  245  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  39.95 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  40.2 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  40.89 
 
 		 376 aa  242  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  36.68 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  41.18 
 
 		 374 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  40.25 
 
 		 384 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  38.86 
 
 		 383 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  39.9 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  41.92 
 
 		 362 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  41.92 
 
 		 362 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  41.92 
 
 		 362 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  39.85 
 
 		 384 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  38.86 
 
 		 383 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  41.44 
 
 		 386 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  38.78 
 
 		 380 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  39.75 
 
 		 384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  39.75 
 
 		 384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  39.75 
 
 		 384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  39.75 
 
 		 384 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  39.75 
 
 		 384 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  40.43 
 
 		 379 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  39.02 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  41.1 
 
 		 380 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  39.23 
 
 		 379 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  40.82 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  41.76 
 
 		 361 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  39.24 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  37.76 
 
 		 380 aa  230  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4385  outer membrane protein, (porin)  38.34 
 
 		 380 aa  229  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  39.09 
 
 		 383 aa  229  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  37.5 
 
 		 380 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  38.44 
 
 		 392 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  38.71 
 
 		 387 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  38.05 
 
 		 379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  38.05 
 
 		 379 aa  225  8e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  38.05 
 
 		 379 aa  225  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  38.05 
 
 		 379 aa  225  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  37.79 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  41.29 
 
 		 383 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  37.5 
 
 		 380 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  38.61 
 
 		 380 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  37.91 
 
 		 376 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  37.91 
 
 		 376 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  37.91 
 
 		 376 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  37.91 
 
 		 376 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  38.29 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  38.61 
 
 		 380 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  37.91 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  37.6 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>