More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3121 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4436  transcriptional regulator  70.15 
 
 		 514 aa  669    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4039  transcriptional regulator  71.43 
 
 		 494 aa  688    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.185178 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1880  GntR family transcriptional regulator  71.86 
 
 		 494 aa  694    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3121  transcriptional regulator  100 
 
 		 495 aa  986    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3558  GntR family transcriptional regulator  70.4 
 
 		 497 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1930  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  60.97 
 
 		 498 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0983  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  55.22 
 
 		 517 aa  538  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3431  GntR family transcriptional regulator  56.28 
 
 		 492 aa  535  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.875541  normal  0.885014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0599  putative transcription regulator protein  55.49 
 
 		 504 aa  522  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0558391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2661  GntR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 483 aa  521  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0327795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0515  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  56.75 
 
 		 487 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.663704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0528  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  56.75 
 
 		 487 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0868  GntR family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 606 aa  495  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2460  GntR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 478 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3430  GntR family transcriptional regulator  53.21 
 
 		 521 aa  484  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.527841  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5367  transcriptional regulator  52.7 
 
 		 494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336445 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 478 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  38.69 
 
 		 483 aa  339  7e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 483 aa  337  2.9999999999999997e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.49 
 
 		 492 aa  334  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1173  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  39.5 
 
 		 486 aa  333  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.914694  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 487 aa  330  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.8 
 
 		 480 aa  329  7e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 473 aa  326  5e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 477 aa  326  6e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 477 aa  323  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  41.14 
 
 		 492 aa  322  7e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  39.92 
 
 		 473 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  38.2 
 
 		 479 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  40.72 
 
 		 469 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 473 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 479 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 469 aa  320  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3105  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.5 
 
 		 486 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.19 
 
 		 479 aa  319  7.999999999999999e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.49 
 
 		 477 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  40.96 
 
 		 474 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 473 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 482 aa  317  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1932  GntR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 476 aa  316  5e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00018992  normal  0.474146 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  39.28 
 
 		 491 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  39.41 
 
 		 478 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.74 
 
 		 475 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 475 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 473 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  38.48 
 
 		 474 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 532 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  38.48 
 
 		 471 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  38.48 
 
 		 500 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 474 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 474 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 474 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 496 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 474 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  38.11 
 
 		 475 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 496 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  38.14 
 
 		 474 aa  310  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  40.04 
 
 		 472 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2044  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  37.13 
 
 		 468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00402201  hitchhiker  0.0000000000000583102 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  38.14 
 
 		 474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  39.41 
 
 		 473 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 473 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 469 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  38.76 
 
 		 469 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1523  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 468 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  39.92 
 
 		 474 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 476 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 474 aa  307  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 468 aa  307  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  36.92 
 
 		 468 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.92 
 
 		 468 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  36.92 
 
 		 468 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 468 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  36.63 
 
 		 475 aa  306  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 473 aa  306  6e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 475 aa  306  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1939  transcriptional regulator  35.68 
 
 		 476 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0234327  normal  0.0215976 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  38.69 
 
 		 479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  37.71 
 
 		 474 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 479 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  40.17 
 
 		 493 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  39.32 
 
 		 496 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  38.9 
 
 		 479 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  40.72 
 
 		 473 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 474 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>