229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05450 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  100 
 
 		 853 aa  1726    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.69 
 
 		 729 aa  490  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  42.4 
 
 		 698 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.9 
 
 		 626 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  39.34 
 
 		 741 aa  375  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  43.07 
 
 		 899 aa  333  9e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.02 
 
 		 743 aa  331  4e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  42.74 
 
 		 743 aa  319  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.91 
 
 		 502 aa  216  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  48.65 
 
 		 629 aa  212  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  43.08 
 
 		 539 aa  205  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  38.86 
 
 		 459 aa  191  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  38.86 
 
 		 459 aa  191  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.75 
 
 		 568 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.32 
 
 		 465 aa  188  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.2 
 
 		 732 aa  167  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.79 
 
 		 421 aa  164  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  36.08 
 
 		 810 aa  161  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  38.13 
 
 		 734 aa  161  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  38.38 
 
 		 805 aa  160  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.43 
 
 		 683 aa  158  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  38.17 
 
 		 609 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  38.17 
 
 		 609 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  38.02 
 
 		 587 aa  155  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  34.15 
 
 		 822 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  42.58 
 
 		 655 aa  152  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  37.87 
 
 		 781 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  34.63 
 
 		 700 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.13 
 
 		 754 aa  148  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  37.93 
 
 		 678 aa  147  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.2 
 
 		 765 aa  143  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.02 
 
 		 530 aa  142  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  43.53 
 
 		 345 aa  140  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  32.87 
 
 		 638 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.61 
 
 		 685 aa  132  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  34.41 
 
 		 705 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  35.14 
 
 		 685 aa  126  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  34.68 
 
 		 691 aa  125  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.22 
 
 		 590 aa  124  9e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.9 
 
 		 585 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  32.18 
 
 		 303 aa  117  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  39.86 
 
 		 333 aa  111  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  36.32 
 
 		 603 aa  111  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  40.12 
 
 		 862 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  41.82 
 
 		 517 aa  110  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  36.41 
 
 		 845 aa  109  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  38.07 
 
 		 662 aa  108  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.38 
 
 		 398 aa  107  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  33.33 
 
 		 450 aa  107  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  34.24 
 
 		 481 aa  107  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  29.45 
 
 		 666 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  30.6 
 
 		 498 aa  103  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  40.12 
 
 		 517 aa  103  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  35.93 
 
 		 412 aa  103  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.21 
 
 		 723 aa  102  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  31.84 
 
 		 498 aa  101  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  39.39 
 
 		 696 aa  101  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  30.24 
 
 		 999 aa  101  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  32.92 
 
 		 851 aa  101  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  36.02 
 
 		 687 aa  100  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  38.96 
 
 		 605 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  40.12 
 
 		 834 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  36.63 
 
 		 900 aa  97.8  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  33.52 
 
 		 571 aa  97.8  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.76 
 
 		 795 aa  97.4  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  40.56 
 
 		 598 aa  96.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.76 
 
 		 510 aa  95.1  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  31.43 
 
 		 352 aa  94.4  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  34.84 
 
 		 341 aa  93.6  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  32.49 
 
 		 513 aa  91.7  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  32.14 
 
 		 513 aa  91.3  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  32.39 
 
 		 653 aa  90.9  8e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.16 
 
 		 603 aa  88.6  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  36.46 
 
 		 722 aa  87.8  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.09 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.03 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.19 
 
 		 748 aa  77.8  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3383  restriction endonuclease  34.4 
 
 		 351 aa  77.4  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1552  hypothetical protein  35.57 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0825  hypothetical protein  36.75 
 
 		 301 aa  73.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.97 
 
 		 530 aa  72  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_002936  DET1113  hypothetical protein  38.3 
 
 		 161 aa  71.6  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0217966  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0004  restriction endonuclease  32.03 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689033  hitchhiker  0.00578502 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0015  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  24.45 
 
 		 597 aa  71.2  0.00000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.7 
 
 		 606 aa  70.5  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  28 
 
 		 330 aa  69.7  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  31.4 
 
 		 803 aa  68.6  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.8 
 
 		 651 aa  63.2  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3625  hypothetical protein  29.86 
 
 		 346 aa  62  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  25.66 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  25.6 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.61 
 
 		 559 aa  60.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1023  ATPase  35.05 
 
 		 599 aa  60.8  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  30.6 
 
 		 271 aa  59.7  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.95 
 
 		 668 aa  58.2  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  26.35 
 
 		 679 aa  58.2  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1001  ATPase  30.73 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00172806  hitchhiker  0.00521543 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05230  hypothetical protein  30.66 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  26.9 
 
 		 391 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2750  hypothetical protein  23.53 
 
 		 208 aa  55.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.216943  hitchhiker  0.00281917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>