More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3465 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
142 aa  290  6e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  99.3 
 
 
145 aa  287  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3829  hypothetical protein  64.23 
 
 
137 aa  159  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3545  hypothetical protein  79.61 
 
 
140 aa  159  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  35.21 
 
 
144 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  37.86 
 
 
139 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2969  helix-turn-helix domain-containing protein  43.18 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  4.18472e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5811  helix-turn-helix domain-containing protein  37.96 
 
 
141 aa  77  7e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  50.68 
 
 
301 aa  76.6  1e-13  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  35.77 
 
 
139 aa  75.5  2e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  43.24 
 
 
117 aa  68.6  3e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 
123 aa  67.8  4e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 
115 aa  67.4  6e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  33.33 
 
 
114 aa  66.6  1e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1144  helix-turn-helix domain-containing protein  32.62 
 
 
145 aa  65.9  2e-10  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.3392e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 
111 aa  65.1  4e-10  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.60527e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  37.19 
 
 
124 aa  64.3  5e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 
137 aa  63.2  1e-09  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  44.16 
 
 
115 aa  62.4  2e-09  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.42648e-12  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  44.16 
 
 
115 aa  62.4  2e-09  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.52617e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  43.84 
 
 
125 aa  61.6  3e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 
321 aa  61.6  4e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  37.17 
 
 
151 aa  61.2  4e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  32.8 
 
 
142 aa  59.7  1e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 
231 aa  58.9  2e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1067  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
82 aa  58.2  4e-08  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0145003  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 
110 aa  57.8  5e-08  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 
281 aa  57.4  6e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  7.86405e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 
152 aa  57.8  6e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  1.19777e-11  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 
128 aa  57.4  6e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  6.72654e-05  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  45.71 
 
 
206 aa  56.6  1e-07  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0468  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 
82 aa  56.6  1e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  1.57698e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 
143 aa  56.6  1e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  35.42 
 
 
139 aa  56.2  1e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  40.26 
 
 
200 aa  56.2  2e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.78065e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 
152 aa  55.8  2e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 
137 aa  54.7  4e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 
206 aa  54.3  6e-07  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 
97 aa  53.5  8e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 
334 aa  53.5  9e-07  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  7.90722e-13 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 
133 aa  53.5  9e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.03467e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  36.84 
 
 
349 aa  53.1  1e-06  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 
135 aa  53.1  1e-06  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
244 aa  53.1  1e-06  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0337  DNA-binding protein  45 
 
 
135 aa  53.1  1e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3686  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 
133 aa  52.8  2e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
300 aa  52.4  2e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  3.32957e-11  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  26.19 
 
 
125 aa  52  3e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  26.19 
 
 
125 aa  52  3e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  26.19 
 
 
125 aa  52  3e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  35.14 
 
 
99 aa  51.6  3e-06  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  29.25 
 
 
125 aa  52  3e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  29.25 
 
 
125 aa  52  3e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  29.25 
 
 
125 aa  52  3e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  26.19 
 
 
125 aa  52  3e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
133 aa  51.6  3e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  38.1 
 
 
117 aa  51.2  4e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  1.0572e-06  hitchhiker  2.67972e-05 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.33 
 
 
72 aa  51.6  4e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  1.42015e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  30.7 
 
 
100 aa  51.2  4e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  26.19 
 
 
125 aa  51.2  5e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 
250 aa  50.8  6e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 
128 aa  50.8  6e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 
118 aa  50.8  6e-06  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  6.79525e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 
115 aa  50.4  7e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 
111 aa  50.8  7e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 
114 aa  50.4  8e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  7.59518e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1099  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 
115 aa  50.4  9e-06  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2624  XRE family transcriptional regulator  32.67 
 
 
112 aa  49.7  1e-05  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00551798  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 
206 aa  50.1  1e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 
75 aa  50.1  1e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 
75 aa  50.1  1e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 
131 aa  50.1  1e-05  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 
144 aa  50.1  1e-05  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 
175 aa  49.7  1e-05  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.33 
 
 
122 aa  49.7  1e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  38.33 
 
 
141 aa  49.7  1e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 
75 aa  50.1  1e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.33 
 
 
122 aa  49.7  1e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 
194 aa  50.1  1e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  35.8 
 
 
149 aa  48.9  2e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.14379e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  35.96 
 
 
104 aa  49.3  2e-05  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  35.8 
 
 
92 aa  49.3  2e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  30.69 
 
 
370 aa  49.3  2e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 
78 aa  49.3  2e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 
327 aa  48.9  2e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0652  XRE family transcriptional regulator  32.38 
 
 
115 aa  49.3  2e-05  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
128 aa  48.9  2e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  40 
 
 
74 aa  48.5  3e-05  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 
114 aa  48.1  3e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  2.00631e-08  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 
117 aa  48.5  3e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 
113 aa  48.5  3e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 
69 aa  48.5  3e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  35.8 
 
 
149 aa  48.5  3e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.85883e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 
69 aa  48.5  3e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  33.68 
 
 
113 aa  48.5  3e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.71645e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  35.8 
 
 
149 aa  48.5  3e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.16919e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 
258 aa  48.5  3e-05  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  33.68 
 
 
113 aa  48.5  3e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0599  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 
73 aa  48.9  3e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.33 
 
 
122 aa  48.9  3e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>