More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3465 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  290  6e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  99.3 
 
 		 145 aa  287  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3545  hypothetical protein  79.61 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3829  hypothetical protein  64.23 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  35.21 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  37.86 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2969  helix-turn-helix domain-containing protein  43.18 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5811  helix-turn-helix domain-containing protein  37.96 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  50.68 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  35.77 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  43.24 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1144  helix-turn-helix domain-containing protein  32.62 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  43.84 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  37.17 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 		 321 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1067  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0145003  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 281 aa  57.4  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0468  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000157698  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  45.71 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  40.26 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 334 aa  53.5  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 244 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  36.84 
 
 		 349 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0337  DNA-binding protein  45 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 300 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3686  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  26.19 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  26.19 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  26.19 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  26.19 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  29.25 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  29.25 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  29.25 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  38.1 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.33 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  26.19 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 		 250 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1099  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 115 aa  50.4  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.33 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.33 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  38.33 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2624  XRE family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00551798  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  35.96 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  35.8 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 327 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0652  XRE family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 370 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  40 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  33.68 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  35.8 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  35.8 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 258 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  35.8 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2300  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0137231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.33 
 
 		 122 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0599  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 73 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>