More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7587 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7587  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 241 aa  480  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7169  short chain dehydrogenase  48.72 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.934383 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2100  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.51 
 
 		 226 aa  201  7e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1577  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.63 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.062462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.91 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.54 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.379017  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3805  short chain dehydrogenase  51.06 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132901  hitchhiker  0.00346902 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0583  putative short-chain dehydrogenase/reductase  49.56 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00177948  normal  0.463308 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0911  short chain dehydrogenase  49.36 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.48 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.114405  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3568  short chain dehydrogenase  48.93 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0488562  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5484  short chain dehydrogenase  48.93 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.485941 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4799  short chain dehydrogenase  48.93 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4179  short chain dehydrogenase  50.64 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0383999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4701  short chain dehydrogenase  49.35 
 
 		 237 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.24 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.3 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0457321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.24 
 
 		 234 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.74 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.874533  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.58 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.214682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.419442  unclonable  0.00000816972 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 		 228 aa  142  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.912393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3589  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.65 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.24 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.16 
 
 		 233 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000124511  unclonable  0.0000000105469 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0110746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  45.29 
 
 		 1695 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.233429  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 		 235 aa  125  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 		 244 aa  122  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134822  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 		 235 aa  121  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4854  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.09 
 
 		 236 aa  118  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0657212  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.057049  hitchhiker  0.000702749 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.485877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0025  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.12 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0110624  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.239235  normal  0.254296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3439  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.36 
 
 		 229 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000413272 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1487  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1308  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.480054  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 236 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1335  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0973  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0318  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.594764  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1235  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1561  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 		 516 aa  109  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.636243  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0594  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.512344  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3985  short chain dehydrogenase  35.16 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.473882  normal  0.0186737 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2495  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.74 
 
 		 247 aa  108  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1500  short chain dehydrogenase  36.25 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22780  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  33.88 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.503497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.75 
 
 		 266 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 		 277 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.92 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6108  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  33.33 
 
 		 248 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1106  short chain dehydrogenase  34.38 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179926  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4102  short chain dehydrogenase  35.06 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.188504 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.34 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.94 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.74 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1189  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 		 258 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.169392  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.13 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00117266  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0197  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.74 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00620  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  33.74 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.297652  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3677  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4567  short chain dehydrogenase  34.66 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.16205  hitchhiker  0.000267636 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.34 
 
 		 246 aa  102  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3966  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 		 251 aa  101  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5592  short chain dehydrogenase  34.54 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0383111 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3659  short chain dehydrogenase  34.54 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.821403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4708  short chain dehydrogenase  34.54 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.978516  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7060  short chain dehydrogenase  34.15 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.89 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.155975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>