More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1091 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  84.5 
 
 		 468 aa  749    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  84.28 
 
 		 468 aa  748    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  93.94 
 
 		 462 aa  822    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  84.28 
 
 		 468 aa  748    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  79.74 
 
 		 463 aa  696    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  84.06 
 
 		 468 aa  746    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  93.48 
 
 		 462 aa  820    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  84.28 
 
 		 468 aa  748    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  95.45 
 
 		 462 aa  833    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  84.28 
 
 		 468 aa  748    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  79.65 
 
 		 470 aa  697    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  83.55 
 
 		 464 aa  745    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  79.42 
 
 		 470 aa  694    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  84.28 
 
 		 468 aa  748    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  100 
 
 		 462 aa  886    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  100 
 
 		 462 aa  886    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  94.16 
 
 		 462 aa  823    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  100 
 
 		 462 aa  886    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  40.32 
 
 		 471 aa  289  9e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  40.32 
 
 		 471 aa  288  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  39 
 
 		 470 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0418  MATE efflux family protein  44.52 
 
 		 448 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0686171 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  38.46 
 
 		 470 aa  264  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  37.67 
 
 		 474 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  37.66 
 
 		 467 aa  239  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  38.5 
 
 		 470 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1146  MATE efflux family protein  38.31 
 
 		 469 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.890459  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  37.27 
 
 		 462 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  37.67 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  38.27 
 
 		 460 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  37.31 
 
 		 472 aa  237  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  38.58 
 
 		 470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  37.19 
 
 		 460 aa  232  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0014  putative multidrug resistance protein norM  37.79 
 
 		 460 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  37.27 
 
 		 462 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  38.86 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  37.27 
 
 		 462 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  37.69 
 
 		 461 aa  229  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  35.16 
 
 		 456 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  38.44 
 
 		 464 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0115  multidrug resistance protein NorM, putative  39.14 
 
 		 460 aa  226  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6069  multidrug efflux protein NorA  37.92 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0664  MATE efflux family protein  38.16 
 
 		 472 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.253686 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0643  MATE efflux family protein  36.3 
 
 		 477 aa  223  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0676  MATE efflux family protein  37.93 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.441843  normal  0.0136882 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  33.55 
 
 		 465 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2521  multi anti extrusion protein MatE  39.58 
 
 		 490 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  34.16 
 
 		 477 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69890  multidrug efflux protein NorA  37.97 
 
 		 488 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  34.08 
 
 		 466 aa  211  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  34.16 
 
 		 477 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1699  MATE efflux family protein  32.96 
 
 		 462 aa  210  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.4571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  34.28 
 
 		 477 aa  209  6e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  32.5 
 
 		 472 aa  209  7e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  34.08 
 
 		 460 aa  209  8e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  34.62 
 
 		 458 aa  205  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  38.39 
 
 		 462 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  33.56 
 
 		 458 aa  204  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  33.41 
 
 		 457 aa  203  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  33.87 
 
 		 467 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 478 aa  201  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  34.62 
 
 		 466 aa  200  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  35.97 
 
 		 451 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  34.78 
 
 		 453 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  34.38 
 
 		 457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  30 
 
 		 457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  33.95 
 
 		 453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  30.63 
 
 		 452 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  35.73 
 
 		 451 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  31.15 
 
 		 460 aa  196  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  33.03 
 
 		 457 aa  196  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 450 aa  196  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04042  multidrug efflux protein  34.84 
 
 		 441 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  30.35 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  32 
 
 		 458 aa  195  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0033  MATE efflux family protein  35.28 
 
 		 463 aa  194  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  30.13 
 
 		 453 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  30.13 
 
 		 453 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  30.13 
 
 		 453 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  30.02 
 
 		 453 aa  193  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3598  multidrug efflux protein  33.41 
 
 		 454 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  29.71 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 467 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  31.98 
 
 		 457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  32.05 
 
 		 458 aa  189  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  29.37 
 
 		 452 aa  189  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  29.54 
 
 		 454 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  29.58 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  34.32 
 
 		 459 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  32.05 
 
 		 457 aa  187  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  29.56 
 
 		 452 aa  186  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  31.08 
 
 		 457 aa  186  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2021  MATE efflux family protein  32.53 
 
 		 459 aa  186  9e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.068877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  32.88 
 
 		 459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  32.88 
 
 		 459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  32.42 
 
 		 459 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  32.88 
 
 		 459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  30.86 
 
 		 457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  30.86 
 
 		 457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  31.76 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>