More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_4539 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  70.75 
 
 
630 aa  964    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  70.75 
 
 
630 aa  964    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  70.75 
 
 
630 aa  964    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2507  transposase B  70.75 
 
 
630 aa  964    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  70.75 
 
 
630 aa  964    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  70.75 
 
 
630 aa  964    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  70.75 
 
 
630 aa  964    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  100 
 
 
637 aa  1329    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  42.12 
 
 
498 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06600  site-specific recombinase, integrase family  32.76 
 
 
491 aa  246  6.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101148  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5578  phage integrase  31.82 
 
 
721 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5981  phage integrase family protein  31.82 
 
 
721 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.259227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1705  phage integrase family protein  31.82 
 
 
737 aa  242  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602648  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  32.4 
 
 
663 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20690  site-specific recombinase, integrase family  33.49 
 
 
426 aa  228  3e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0987  Tn554-related, transposase B  29.43 
 
 
708 aa  210  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.376449  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0001  Tn554-related, transposase B  27.16 
 
 
684 aa  201  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.289716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3148  Tn554-related, transposase B  27.16 
 
 
701 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1465  Tn554-related, transposase B  26.63 
 
 
675 aa  176  9e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000329851  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4644  phage integrase family protein  27.01 
 
 
637 aa  150  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1114  phage integrase family protein  25.06 
 
 
637 aa  134  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5498  phage integrase family protein  23.3 
 
 
647 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0714023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0456  phage integrase family protein  23.3 
 
 
647 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3588  phage integrase family protein  23.3 
 
 
647 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00892563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3903  phage integrase family protein  26.35 
 
 
724 aa  109  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5934  phage integrase family protein  26.35 
 
 
724 aa  109  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3897  phage integrase family protein  26.35 
 
 
724 aa  109  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0479  phage integrase family protein  26.35 
 
 
724 aa  109  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3615  integrase family protein  25.27 
 
 
638 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00140934  normal  0.0339314 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0068  integrase family protein  26.03 
 
 
461 aa  107  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5419  phage integrase family protein  36.96 
 
 
741 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.244002 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5399  phage integrase family protein  36.96 
 
 
741 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.558609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0513  phage integrase family protein  36.96 
 
 
741 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1427  phage integrase family protein  37.7 
 
 
739 aa  97.1  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2584  integrase family protein  23.91 
 
 
608 aa  94.4  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2671  integrase family protein  23.91 
 
 
608 aa  94.4  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  23.65 
 
 
608 aa  94  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  20.65 
 
 
617 aa  87  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  20.65 
 
 
617 aa  87  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3468  integrase family protein  25.94 
 
 
719 aa  86.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00341973  normal  0.0358232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3741  integrase family protein  25.94 
 
 
719 aa  86.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  0.164108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3699  integrase family protein  25.94 
 
 
719 aa  86.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0398005  normal  0.195076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1216  integrase family protein  25.94 
 
 
719 aa  86.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324318  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3604  integrase family protein  25.94 
 
 
719 aa  86.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0140825  normal  0.0766423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3043  integrase family protein  25.94 
 
 
719 aa  86.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00307933  hitchhiker  0.00706888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3586  integrase family protein  25.94 
 
 
719 aa  86.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.186678  hitchhiker  0.00677249 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  26.54 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  24.81 
 
 
297 aa  83.2  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3804  phage integrase family protein  24.25 
 
 
710 aa  80.1  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3969  phage integrase family protein  24.25 
 
 
710 aa  80.1  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1935  phage integrase  24.25 
 
 
710 aa  80.1  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  26.36 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  25.9 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.52 
 
 
299 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.52 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.52 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  26.82 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.52 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.52 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0992  phage integrase family protein  27.27 
 
 
806 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.52 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.08 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.09 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.52 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.09 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.09 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4521  phage integrase family protein  26.82 
 
 
803 aa  74.7  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0704652  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  27.54 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  27.86 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.52 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  23.76 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  23.68 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  24.15 
 
 
306 aa  73.6  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.88 
 
 
299 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  25.09 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  24.71 
 
 
310 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  23.96 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  23.92 
 
 
296 aa  72.4  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  28.35 
 
 
298 aa  72  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  22.97 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  27.17 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  27.94 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  26.3 
 
 
290 aa  70.1  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  26.21 
 
 
407 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  26.27 
 
 
303 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  30 
 
 
304 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  24.9 
 
 
296 aa  69.3  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.73 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  24.77 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  26.69 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  35.83 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  27.48 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  29.58 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0386  phage integrase family site specific recombinase  24.13 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  29.58 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  29.58 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  29.58 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  29.58 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  26.89 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.77 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>