More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0174 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0174  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  81.19 
 
 		 219 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0096  hypothetical protein  80.93 
 
 		 225 aa  362  3e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480165  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  78.6 
 
 		 224 aa  352  4e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  80.75 
 
 		 221 aa  348  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0438  hypothetical protein  79.34 
 
 		 221 aa  346  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0288  alanine racemase domain protein  78.74 
 
 		 219 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  70.7 
 
 		 232 aa  311  4.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  66.2 
 
 		 225 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  65.7 
 
 		 227 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  65.26 
 
 		 219 aa  280  9e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0226  alanine racemase domain-containing protein  60.79 
 
 		 230 aa  278  4e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  64.29 
 
 		 227 aa  278  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0335  alanine racemase domain protein  64.13 
 
 		 230 aa  278  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00537658 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1094  alanine racemase domain-containing protein  63.51 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1808  hypothetical protein  64.79 
 
 		 226 aa  275  5e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3197  alanine racemase domain-containing protein  63.85 
 
 		 219 aa  275  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3923  alanine racemase domain protein  63.38 
 
 		 219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823584  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1741  hypothetical protein  64.79 
 
 		 226 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  58.33 
 
 		 244 aa  272  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4249  alanine racemase domain protein  63.85 
 
 		 219 aa  271  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.405464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  60 
 
 		 247 aa  267  8.999999999999999e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1285  alanine racemase domain-containing protein  65.62 
 
 		 230 aa  266  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  59.53 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3634  hypothetical protein  59.62 
 
 		 242 aa  262  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  57.67 
 
 		 250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  61.03 
 
 		 217 aa  248  6e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  60.59 
 
 		 218 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0414  hypothetical protein  59.22 
 
 		 217 aa  243  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0102  hypothetical protein  52.51 
 
 		 226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  58.88 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  58.69 
 
 		 220 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5034  alanine racemase domain-containing protein  62.69 
 
 		 214 aa  234  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  59.15 
 
 		 221 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0844  hypothetical protein  62.18 
 
 		 221 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2502  alanine racemase domain-containing protein  61.86 
 
 		 221 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.936846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2952  hypothetical protein  50.88 
 
 		 225 aa  226  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0433  hypothetical protein  59.38 
 
 		 191 aa  223  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  53.33 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  60.62 
 
 		 220 aa  219  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2054  alanine racemase domain-containing protein  56.22 
 
 		 229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0733965  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0628  alanine racemase domain protein  55.44 
 
 		 248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0643141 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  46.63 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2164  alanine racemase domain protein  42.63 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  47.42 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  47.42 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  47.42 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  44.39 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  47.94 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  43.95 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  42.92 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  40.62 
 
 		 230 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  39.56 
 
 		 235 aa  144  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  41.96 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  38.84 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  41.48 
 
 		 241 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  39.29 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  43.44 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  39.81 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  38.84 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  37.89 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0647  alanine racemase domain-containing protein  43.56 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  42.08 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0621  hypothetical protein  44.06 
 
 		 268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2875  alanine racemase domain protein  39.04 
 
 		 234 aa  134  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  41.63 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  39.91 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  44.06 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  42.08 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  44.06 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  43.56 
 
 		 232 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  41.33 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  38.46 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  41.67 
 
 		 231 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  38.18 
 
 		 229 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  43.44 
 
 		 232 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  38.26 
 
 		 241 aa  131  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  36.89 
 
 		 231 aa  131  9e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  38.71 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  38.67 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  39.65 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  41.63 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  37.56 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  39.53 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  34.23 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  38.05 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  44.16 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  37.73 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  40 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  39.3 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  36.2 
 
 		 233 aa  128  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2507  alanine racemase domain protein  43.36 
 
 		 238 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  37.72 
 
 		 233 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  36.4 
 
 		 244 aa  128  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  37.67 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0545  alanine racemase domain-containing protein  38.84 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2655  alanine racemase domain-containing protein  46.04 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.042433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  41.18 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  43.07 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  37.05 
 
 		 235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>