More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0025 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  100 
 
 
219 aa  431  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.38 
 
 
221 aa  184  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  46.67 
 
 
235 aa  182  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40 
 
 
220 aa  178  5e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  38.76 
 
 
218 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  39.07 
 
 
219 aa  152  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.83 
 
 
222 aa  149  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  41.38 
 
 
220 aa  147  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  38.65 
 
 
221 aa  147  1e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  44.24 
 
 
229 aa  145  7e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  38.16 
 
 
221 aa  144  8e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1301  HAD superfamily hydrolase  37.86 
 
 
217 aa  144  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.193279  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  38.16 
 
 
225 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1248  putative phosphatase  37.86 
 
 
245 aa  143  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0320167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  37.2 
 
 
221 aa  142  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  37.2 
 
 
221 aa  142  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.29 
 
 
217 aa  141  1e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  38.5 
 
 
221 aa  139  2e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.23811e-27 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.78 
 
 
217 aa  139  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  37.2 
 
 
221 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  45.18 
 
 
231 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  38.5 
 
 
221 aa  138  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  38.5 
 
 
221 aa  138  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  38.58 
 
 
221 aa  136  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  36.84 
 
 
227 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  40 
 
 
220 aa  132  4e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  37.85 
 
 
216 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  42.27 
 
 
221 aa  131  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  42.05 
 
 
221 aa  131  7e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  34.62 
 
 
216 aa  129  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  40.29 
 
 
214 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  37.56 
 
 
216 aa  128  7e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  40.41 
 
 
215 aa  127  1e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  37.56 
 
 
237 aa  127  1e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  38.27 
 
 
224 aa  126  2e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.37 
 
 
221 aa  125  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.20461e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0568  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  45.6 
 
 
226 aa  125  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.939008  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  40.38 
 
 
221 aa  124  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  36.62 
 
 
224 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.98417e-05 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.19 
 
 
238 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01178e-11 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.55 
 
 
232 aa  122  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  32.04 
 
 
211 aa  121  8e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  1.03613e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.07 
 
 
228 aa  118  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2284  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.04 
 
 
223 aa  117  2e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1603  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.79 
 
 
219 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.699082  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  41.8 
 
 
228 aa  114  1e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  39.27 
 
 
291 aa  110  1e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.42 
 
 
220 aa  111  1e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  37.61 
 
 
231 aa  110  2e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  41.88 
 
 
225 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  41.88 
 
 
225 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  41.88 
 
 
225 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.81 
 
 
228 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0621452  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0469  phosphatase  32.03 
 
 
239 aa  105  7e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.876662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 
226 aa  98.2  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  36.25 
 
 
247 aa  97.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  30.7 
 
 
227 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  31.46 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  31.46 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  30.52 
 
 
227 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1536  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.41 
 
 
223 aa  95.1  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.344514  normal  0.620103 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0795  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.22 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3563  hydrolase  34.12 
 
 
232 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  35.24 
 
 
223 aa  92.8  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  29.49 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.02 
 
 
252 aa  92.4  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  29.49 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  29.49 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  33.17 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  31.31 
 
 
213 aa  90.1  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  35.23 
 
 
272 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  29.49 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  29.78 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  35.35 
 
 
225 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  30.3 
 
 
213 aa  87  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  29.11 
 
 
243 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1470  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  29.8 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000674726  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  30.1 
 
 
218 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  30.09 
 
 
227 aa  87  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  29.55 
 
 
223 aa  86.3  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  30.52 
 
 
272 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  28.37 
 
 
233 aa  86.3  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  27.05 
 
 
226 aa  86.3  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3621  HAD family hydrolase  39.68 
 
 
228 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  34.38 
 
 
226 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  29.52 
 
 
227 aa  84.7  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  29.52 
 
 
227 aa  84.7  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 
272 aa  84.7  1e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.52 
 
 
225 aa  84.3  1e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  34.2 
 
 
272 aa  83.6  2e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  33.95 
 
 
216 aa  84  2e-15  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.44 
 
 
212 aa  83.2  2e-15  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3132  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.33 
 
 
226 aa  83.2  3e-15  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  31.43 
 
 
272 aa  82.8  4e-15  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  30.14 
 
 
210 aa  82.8  4e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  33.68 
 
 
272 aa  82.4  4e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
243 aa  82.4  5e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  7.36152e-05 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  30.92 
 
 
226 aa  82.4  5e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 
228 aa  82.4  5e-15  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  32 
 
 
226 aa  82  6e-15  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>