54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4599 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  661    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  70.09 
 
 
327 aa  446  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  59.69 
 
 
326 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  59.69 
 
 
322 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  59.69 
 
 
325 aa  380  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  59.69 
 
 
322 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  51.11 
 
 
341 aa  318  9e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  49.06 
 
 
332 aa  291  8e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  50.85 
 
 
337 aa  275  6e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  48.45 
 
 
326 aa  275  8e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  48.45 
 
 
326 aa  275  8e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  35.36 
 
 
405 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  31.47 
 
 
425 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  34.07 
 
 
412 aa  96.3  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4853  TPR repeat-containing protein  30.62 
 
 
421 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  35.84 
 
 
1621 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
994 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  32.51 
 
 
416 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 
1779 aa  80.5  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  36.16 
 
 
1219 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 
1448 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 
1711 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  33.33 
 
 
501 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 
1502 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  33.51 
 
 
724 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  32.55 
 
 
393 aa  72.8  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  28.89 
 
 
426 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.021674 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  25.35 
 
 
982 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 
1911 aa  70.9  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  27.8 
 
 
934 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 
1083 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  28.43 
 
 
552 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  32.42 
 
 
599 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  30.22 
 
 
1141 aa  63.5  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  30.89 
 
 
714 aa  63.5  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  33.61 
 
 
992 aa  60.8  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
1544 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3809  hypothetical protein  23.98 
 
 
405 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  33.83 
 
 
737 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  27.94 
 
 
720 aa  59.3  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3871  hypothetical protein  72.22 
 
 
42 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 
1321 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
1247 aa  55.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  28.87 
 
 
596 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  30.9 
 
 
1869 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  29.19 
 
 
720 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.75 
 
 
644 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  27.88 
 
 
560 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  30.67 
 
 
962 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  34.57 
 
 
460 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0968  hypothetical protein  24.16 
 
 
419 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.364744  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  28.57 
 
 
476 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  30.93 
 
 
490 aa  43.5  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>