More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1296 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1296  histidine kinase  100 
 
 		 185 aa  373  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2141  histidine kinase  47.16 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0097  histidine kinase  38.8 
 
 		 183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000393331 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0917  histidine kinase  40.68 
 
 		 178 aa  143  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0175  histidine kinase  38.38 
 
 		 184 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2235  histidine kinase  38.71 
 
 		 188 aa  135  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3802  histidine kinase  43.2 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0339  histidine kinase  39.89 
 
 		 188 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000463655  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0545  histidine kinase  35.16 
 
 		 185 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1126  histidine kinase  34.41 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000015615  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1164  histidine kinase  33.87 
 
 		 183 aa  84.7  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00214296  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0915  histidine kinase  36.08 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.932987  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0805  histidine kinase  32.77 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2069  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 		 653 aa  66.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3050  histidine kinase  37.23 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0437  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 412 aa  61.2  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.148474  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  35.11 
 
 		 975 aa  59.7  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 683 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  32.14 
 
 		 626 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4695  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 991 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000969954 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0969  sensory histidine kinase AtoS  36.84 
 
 		 622 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000351141  normal  0.40359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 991 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  hitchhiker  0.0000734254 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1253  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.66 
 
 		 638 aa  58.2  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000228716  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0738  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 991 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000340339 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2633  histidine kinase  37.08 
 
 		 566 aa  58.2  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2759  two component sensor histidine kinase  32.71 
 
 		 764 aa  57.8  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000152723  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2781  histidine kinase  31.93 
 
 		 321 aa  57.8  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  36.25 
 
 		 643 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2978  PAS  42.47 
 
 		 424 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  36.25 
 
 		 643 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  36.25 
 
 		 643 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  30.23 
 
 		 627 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4273  two-component sensor  32.63 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3374  two-component sensor kinase CbrA  33.33 
 
 		 1000 aa  57  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.694338  normal  0.111505 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4604  histidine kinase  35.79 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3069  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1230  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  37.33 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0439907  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0284  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4694  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 991 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000630671 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1510  C4-dicarboxylate transport sensor protein dctB  37.33 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.220294  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2929  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 360 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  30.19 
 
 		 774 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1434  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2939  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.924574  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 		 688 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1172  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3624  ATPase domain-containing protein  33 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0197283  normal  0.342036 
 
 
-
 
NC_002936  DET1293  sensory box sensor histidine kinase  41.33 
 
 		 394 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00147637  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3071  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1339  sensor histidine kinase, C-terminal region; sporulation kinase  30.69 
 
 		 420 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  29.46 
 
 		 627 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  29.46 
 
 		 627 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  29.46 
 
 		 627 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  29.46 
 
 		 627 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.92 
 
 		 556 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 660 aa  55.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.291882  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0299  putative nitrogen regulation protein NtrY  34.88 
 
 		 714 aa  55.5  0.0000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.333561  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4673  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 713 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 		 508 aa  55.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  29.46 
 
 		 627 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 635 aa  55.5  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  29.46 
 
 		 627 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0420  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 458 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00956949  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  31.78 
 
 		 516 aa  55.1  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1182  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.68 
 
 		 417 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1340  sporulation kinase  30.69 
 
 		 420 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1946  histidine kinase  33 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4031  sensory box histidine kinase/response regulator  27.37 
 
 		 851 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0446  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 488 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363501  normal  0.308567 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0124  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.37 
 
 		 851 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  33.66 
 
 		 600 aa  55.1  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1533  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 403 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4013  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 		 636 aa  55.1  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0733  histidine kinase  39.73 
 
 		 1347 aa  54.7  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 1021 aa  54.7  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  31.25 
 
 		 625 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  32.65 
 
 		 620 aa  54.7  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2304  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 460 aa  54.3  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.757006  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  29 
 
 		 622 aa  54.3  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2430  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.68 
 
 		 420 aa  54.3  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  30.69 
 
 		 276 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1583  sensor histidine kinase, putative  29.7 
 
 		 423 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3380  hypothetical protein  33.71 
 
 		 439 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3231  flagellar regulatory protein B  30.51 
 
 		 360 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1619  sensor histidine kinase  29.7 
 
 		 423 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 674 aa  53.9  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.808009  normal  0.64014 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0361  histidine kinase  38.71 
 
 		 468 aa  53.9  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000148321  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  30.1 
 
 		 666 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1279  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 360 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1346  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 360 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4095  sensory box histidine kinase/response regulator  26.84 
 
 		 851 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1381  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.7 
 
 		 416 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413033  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2311  histidine kinase  31.03 
 
 		 347 aa  53.9  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 603 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  40.26 
 
 		 1808 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1391  putative C4-dicarboxylate transport sensor protein  29.81 
 
 		 289 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 598 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  27.36 
 
 		 433 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>