More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4343 on replicon NC_008538
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  485  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  36.57 
 
 		 255 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.6 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  34.06 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  33.63 
 
 		 241 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  30.92 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 303 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.3 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  37.91 
 
 		 268 aa  101  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  33.47 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  27.97 
 
 		 240 aa  98.6  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 242 aa  98.6  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  34.19 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  31.98 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3548  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.36 
 
 		 258 aa  95.9  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.701913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  31.4 
 
 		 239 aa  95.9  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  30.45 
 
 		 241 aa  95.1  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  33.04 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  27.23 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2203  GntR domain protein  31.51 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0471303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  30.74 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 366 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  30.97 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  32.03 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  30.97 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3603  GntR domain-containing protein  33.75 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550725  normal  0.904969 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  27.23 
 
 		 228 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  33.77 
 
 		 240 aa  92.8  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  34.27 
 
 		 250 aa  92.4  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  32.74 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  30.77 
 
 		 269 aa  92  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 228 aa  92  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 248 aa  91.7  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3513  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  32.47 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494425  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  30.53 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  30.47 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  30.95 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3643  GntR domain-containing protein  34.57 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4399  GntR domain protein  34.55 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  35.04 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0759  GntR domain protein  31.84 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  32.17 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  32.05 
 
 		 320 aa  89.7  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4081  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4311  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173639  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4157  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  31.7 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  34.11 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  39.32 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 240 aa  89  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  32.74 
 
 		 237 aa  89  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1676  regulatory protein GntR HTH  41.86 
 
 		 275 aa  89  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0744  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  31.7 
 
 		 258 aa  89  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2064  GntR domain protein  33.48 
 
 		 247 aa  89  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3597  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 279 aa  88.6  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  34.86 
 
 		 227 aa  88.6  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 		 233 aa  88.6  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  30.54 
 
 		 253 aa  88.6  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02963  DNA-binding transcriptional repressor  29.52 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0607  regulatory protein GntR HTH  29.52 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4409  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.52 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3267  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.52 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3281  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.52 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.368173  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0739  GntR domain protein  30.77 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0933877  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  36.36 
 
 		 239 aa  88.6  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  29.8 
 
 		 253 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3391  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.52 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3566  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.52 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02914  hypothetical protein  29.52 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4910  GntR domain protein  30.09 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0602  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.52 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3833  GntR domain protein  30.09 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  34.4 
 
 		 216 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  36.36 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  28.64 
 
 		 233 aa  87.8  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 269 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3965  regulatory protein GntR HTH  31.87 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  35.67 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 246 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>