More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1365 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 
213 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  82.38 
 
 
223 aa  347  6e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  81.43 
 
 
227 aa  342  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  82.38 
 
 
223 aa  322  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  51.94 
 
 
231 aa  192  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  53.27 
 
 
228 aa  191  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  46.29 
 
 
228 aa  191  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  53.54 
 
 
230 aa  191  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  51.44 
 
 
235 aa  191  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  51.76 
 
 
228 aa  191  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  51.26 
 
 
228 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  51.76 
 
 
228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  50.25 
 
 
234 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  50.75 
 
 
228 aa  187  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  49.54 
 
 
230 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  50.68 
 
 
230 aa  186  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  49.27 
 
 
227 aa  185  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  51.23 
 
 
236 aa  184  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  51.96 
 
 
229 aa  184  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  49.76 
 
 
229 aa  184  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  48.56 
 
 
231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  45.22 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  50.5 
 
 
229 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  47.8 
 
 
237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  45.37 
 
 
229 aa  181  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  49.5 
 
 
228 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  44.05 
 
 
229 aa  180  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  49.13 
 
 
228 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  50.25 
 
 
228 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  46.35 
 
 
228 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  46.77 
 
 
226 aa  178  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  53.92 
 
 
257 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  50.5 
 
 
237 aa  177  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  41.58 
 
 
235 aa  177  9e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  48.02 
 
 
241 aa  177  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  53.92 
 
 
239 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  53.92 
 
 
239 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  44.55 
 
 
224 aa  176  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  47.32 
 
 
229 aa  176  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  47.8 
 
 
229 aa  176  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  53.43 
 
 
232 aa  175  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  42.5 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  47.83 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  47.57 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  47.55 
 
 
235 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3923  alanine racemase domain protein  50.51 
 
 
219 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823584  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2682  hypothetical protein  45.19 
 
 
235 aa  170  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00281403  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  43.17 
 
 
226 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  45 
 
 
244 aa  169  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  43.18 
 
 
219 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  48.24 
 
 
244 aa  169  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  44.17 
 
 
232 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4249  alanine racemase domain protein  51.02 
 
 
219 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.405464 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0647  alanine racemase domain-containing protein  51.47 
 
 
232 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0621  hypothetical protein  51.96 
 
 
268 aa  168  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  49.75 
 
 
219 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  54.41 
 
 
232 aa  168  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  47 
 
 
233 aa  168  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  49.29 
 
 
242 aa  168  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  44.24 
 
 
234 aa  168  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  43.44 
 
 
247 aa  167  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  44.17 
 
 
242 aa  167  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  44.17 
 
 
232 aa  167  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2598  hypothetical protein  53.96 
 
 
245 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.734317  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2411  hypothetical protein  53.96 
 
 
245 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.429006  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1189  hypothetical protein  53.96 
 
 
245 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0545  alanine racemase domain-containing protein  44 
 
 
242 aa  166  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  46 
 
 
230 aa  166  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0328  hypothetical protein  53.96 
 
 
245 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  49.23 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  48.26 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  47.52 
 
 
229 aa  165  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3346  hypothetical protein  53.96 
 
 
305 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  45.96 
 
 
227 aa  165  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  51.49 
 
 
229 aa  165  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  49.25 
 
 
232 aa  165  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  42.53 
 
 
247 aa  165  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  47.71 
 
 
232 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3912  alanine racemase domain protein  48.04 
 
 
243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  44.17 
 
 
237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  42.99 
 
 
244 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  44.55 
 
 
228 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2655  alanine racemase domain-containing protein  53.92 
 
 
235 aa  164  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.042433 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3333  hypothetical protein  53.47 
 
 
232 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3299  hypothetical protein  53.47 
 
 
232 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244071  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  50 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  41.67 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  41.47 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  46.5 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  45.37 
 
 
233 aa  162  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  45.79 
 
 
231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  47.21 
 
 
225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  41.58 
 
 
239 aa  161  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  42.36 
 
 
230 aa  161  6e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  48.51 
 
 
271 aa  161  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  36.2 
 
 
219 aa  161  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  41.5 
 
 
228 aa  161  7e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2502  alanine racemase domain-containing protein  48.21 
 
 
221 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.936846  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  49.25 
 
 
271 aa  160  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  48.34 
 
 
238 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>