More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0098 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0098  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 
322 aa  660    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4883  Fmu (Sun) domain protein  43.77 
 
 
323 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3665  Fmu (Sun)/nucleolar NOL1/Nop2p  37.5 
 
 
322 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2380  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.82 
 
 
321 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.15429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2580  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  35.32 
 
 
454 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1591  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  33.88 
 
 
454 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.558771  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1005  rRNA methyltransferase, putative  31.6 
 
 
436 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00439767  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0901  Fmu (Sun) domain-containing protein  35 
 
 
455 aa  125  8.000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1840  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.5 
 
 
482 aa  119  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1267  Fmu (Sun) domain protein  32.28 
 
 
460 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0432  NOL1/NOP2/sun family protein  37.33 
 
 
468 aa  115  7.999999999999999e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.218549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3218  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.66 
 
 
470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1219  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  32.3 
 
 
455 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3160  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  31.76 
 
 
456 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1104  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  35.82 
 
 
458 aa  113  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2079  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.68 
 
 
481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0993  NOL1/NOP2/sun family protein  31.49 
 
 
436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0692  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  33.48 
 
 
470 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.010029  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0979  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  28.98 
 
 
460 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1865  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  32.14 
 
 
468 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.92386  decreased coverage  0.000437678 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2792  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.67 
 
 
488 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000540709  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1328  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  30.92 
 
 
457 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13819  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5890  Fmu (Sun) domain protein  33.19 
 
 
453 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133324  hitchhiker  0.00389453 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01806  predicted methyltransferase  30.2 
 
 
479 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1807  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  30.2 
 
 
481 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0366277  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01794  hypothetical protein  30.2 
 
 
479 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2064  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.2 
 
 
481 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.2344  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2113  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.28 
 
 
503 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0620  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.59 
 
 
474 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109548 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1926  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.2 
 
 
481 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79578  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2103  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.2 
 
 
481 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235271  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1797  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.2 
 
 
481 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.396046  normal  0.0585336 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1352  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.08 
 
 
481 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  normal  0.0948873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6488  Fmu (Sun) domain protein  31 
 
 
464 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.799417 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1848  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  28.74 
 
 
484 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1306  RNA methylase NOL1/NOP2/sun family  32.24 
 
 
457 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.085217 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2172  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  31.2 
 
 
471 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000128077  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2136  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  27.8 
 
 
484 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1281  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.59 
 
 
479 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0638049  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2051  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.04 
 
 
513 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1465  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.59 
 
 
479 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.331125  normal  0.160256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2568  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.8 
 
 
479 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2405  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.24 
 
 
480 aa  99.8  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1993  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.04 
 
 
513 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1989  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.59 
 
 
513 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458134 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1541  RNA methylase  35.42 
 
 
275 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.719796  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1108  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  33.9 
 
 
301 aa  98.2  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000188231  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1485  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  32.68 
 
 
314 aa  96.3  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_2054  predicted protein  32.09 
 
 
485 aa  95.9  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2064  Fmu (Sun) domain protein  32.74 
 
 
479 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  31.82 
 
 
406 aa  94  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1538  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.62 
 
 
473 aa  94  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.317347  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08073  nucleolar RNA methyltransferase (Nop2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01760)  30.69 
 
 
788 aa  93.6  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.322316  normal  0.90309 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  34.03 
 
 
453 aa  93.6  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1936  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  28.12 
 
 
481 aa  92.8  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00306451  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  30.89 
 
 
444 aa  91.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0458  ribosomal RNA methyltransferase NOP2  35.94 
 
 
277 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  30 
 
 
453 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0378  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  35.42 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0306061 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  28.45 
 
 
453 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1110  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  27.06 
 
 
503 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153136  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1457  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  34.65 
 
 
335 aa  90.9  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2749  NOL1/NOP2/sun family protein  32.76 
 
 
319 aa  89.7  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2224  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  28.07 
 
 
481 aa  89.7  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  30.22 
 
 
444 aa  89.4  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0007  ribosomal RNA methyltransferase NOP2  32.91 
 
 
336 aa  89.4  9e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.138281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  30.61 
 
 
450 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.63 
 
 
478 aa  87  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  30.94 
 
 
451 aa  86.7  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0056  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.62 
 
 
485 aa  86.3  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  33.33 
 
 
430 aa  86.7  6e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2455  Fmu (Sun) domain protein  36.78 
 
 
421 aa  86.3  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02352  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  26.92 
 
 
501 aa  86.3  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  30.2 
 
 
450 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  31.3 
 
 
452 aa  85.9  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003425  ribosomal RNA small subunit methyltransferase F  27.23 
 
 
478 aa  85.9  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.837447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.05 
 
 
410 aa  85.9  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1228  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  28.88 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3109  Fmu (Sun) domain protein  34.42 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0039  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  29.06 
 
 
462 aa  85.9  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.86 
 
 
443 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  29.61 
 
 
452 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2201  Fmu (Sun) domain protein  32.65 
 
 
437 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.256814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  29.6 
 
 
448 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  33.51 
 
 
452 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25394  predicted protein  34.41 
 
 
528 aa  84  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  31.77 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  32.29 
 
 
438 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91345  nucleolar RNA methyltransferase  31.98 
 
 
625 aa  84  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  28.26 
 
 
444 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  29.6 
 
 
448 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  29.38 
 
 
442 aa  83.6  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  33.17 
 
 
452 aa  82.8  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0853  Fmu (Sun) domain protein  30 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0666  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  34.31 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02220  nucleolus protein, putative  29.44 
 
 
695 aa  82.4  0.000000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0735574  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2046  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  28.3 
 
 
505 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.362171  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  34.81 
 
 
429 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  31.82 
 
 
438 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  29.96 
 
 
427 aa  82  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>