More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2010 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2010  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 214 aa  410  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.32 
 
 		 219 aa  242  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.24 
 
 		 230 aa  238  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  57.08 
 
 		 215 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2780  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.67 
 
 		 219 aa  228  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  53.33 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  55.92 
 
 		 215 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5656  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.74 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4417  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.87 
 
 		 232 aa  211  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0366  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.01 
 
 		 220 aa  208  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0587069  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.15 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1883  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.66 
 
 		 215 aa  205  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3669  response regulator receiver protein  54.72 
 
 		 213 aa  204  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  53.52 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.11 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.56 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.31 
 
 		 215 aa  202  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.31 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0822  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.93 
 
 		 229 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.17 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.71 
 
 		 224 aa  198  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2024  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.13 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.39 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8799  response regulator receiver protein  53.49 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.76 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  48.58 
 
 		 215 aa  194  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.91 
 
 		 241 aa  194  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  51.15 
 
 		 227 aa  194  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0601  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.05 
 
 		 215 aa  194  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.13 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  51.66 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0759  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.07 
 
 		 221 aa  192  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  48.34 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.24 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.23 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6161  response regulator receiver protein  49.52 
 
 		 221 aa  191  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902987  decreased coverage  0.000109123 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 229 aa  191  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.89 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  50.47 
 
 		 221 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.64 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.42 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.05 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.95 
 
 		 241 aa  189  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.86 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3714  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.58 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.53 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  48.6 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  45.62 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  46.51 
 
 		 218 aa  188  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  50.93 
 
 		 230 aa  187  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.26 
 
 		 231 aa  187  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.73 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1318  response regulator receiver  50.23 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.77 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2232  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.29 
 
 		 302 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.501029  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4001  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.23 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380782  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  49.06 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  51.87 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  48.11 
 
 		 226 aa  185  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.93 
 
 		 234 aa  184  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1746  response regulator receiver protein  48.08 
 
 		 217 aa  185  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.83 
 
 		 230 aa  184  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  48.13 
 
 		 213 aa  184  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  51.18 
 
 		 221 aa  184  9e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04500  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.25 
 
 		 244 aa  184  9e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.61 
 
 		 226 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8800  response regulator receiver protein  50.49 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3768  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.47 
 
 		 223 aa  182  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28303  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.46 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 225 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.92 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.19 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.6 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  46.35 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.97 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  46.45 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2449  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.16 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1960  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 219 aa  181  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  48.57 
 
 		 216 aa  181  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 218 aa  181  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.89 
 
 		 226 aa  181  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0395  two component LuxR family transcriptional regulator  51.64 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4872  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2730  response regulator receiver  47.69 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.776601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  48.84 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>