More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0375 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
544 aa  1052    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27420  methyl-accepting chemotaxis protein  48.19 
 
 
540 aa  376  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  53.88 
 
 
518 aa  351  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  43.49 
 
 
545 aa  342  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.45 
 
 
545 aa  338  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.1 
 
 
522 aa  322  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  43.77 
 
 
533 aa  317  5e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  54.73 
 
 
540 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.98 
 
 
538 aa  313  4.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.22 
 
 
394 aa  311  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  43.17 
 
 
531 aa  311  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.18 
 
 
537 aa  303  6.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  55.73 
 
 
543 aa  301  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.32 
 
 
528 aa  302  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.98 
 
 
547 aa  301  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.9 
 
 
538 aa  299  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018308  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  51.65 
 
 
562 aa  298  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  54.36 
 
 
542 aa  296  6e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30960  methyl-accepting chemotaxis protein  42.97 
 
 
540 aa  293  4e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  43.17 
 
 
533 aa  293  6e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  46.67 
 
 
538 aa  292  8e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.43 
 
 
542 aa  289  8e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  53.47 
 
 
347 aa  289  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  52.54 
 
 
540 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5010  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.95 
 
 
538 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.98 
 
 
623 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.308823 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.07 
 
 
523 aa  283  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00385179  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30940  methyl-accepting chemotaxis protein  51.95 
 
 
407 aa  283  5.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682285  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  42.25 
 
 
530 aa  282  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.81 
 
 
545 aa  280  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0651  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.9 
 
 
535 aa  277  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406234  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3089  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.89 
 
 
526 aa  276  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.91 
 
 
532 aa  274  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.570256  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.06 
 
 
538 aa  273  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.84 
 
 
904 aa  271  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.93 
 
 
546 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.9 
 
 
535 aa  266  5e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286616  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30920  methyl-accepting chemotaxis protein  52.71 
 
 
583 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  52.06 
 
 
535 aa  252  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.58 
 
 
1150 aa  252  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.94 
 
 
702 aa  248  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.67 
 
 
858 aa  247  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.58 
 
 
536 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.73 
 
 
544 aa  239  8e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.11 
 
 
529 aa  239  9e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.72 
 
 
531 aa  228  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.64 
 
 
545 aa  226  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0156977  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0198  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.48 
 
 
715 aa  226  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.419669  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.63 
 
 
550 aa  225  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.37871  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1913  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.34 
 
 
524 aa  224  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0934644  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0049  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.13 
 
 
539 aa  222  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0550535  normal  0.228084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.62 
 
 
562 aa  220  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.18 
 
 
530 aa  217  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3504  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.77 
 
 
657 aa  216  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193477  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
397 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.362921  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  49.05 
 
 
965 aa  210  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.87 
 
 
731 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.97 
 
 
563 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.76 
 
 
566 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.07 
 
 
573 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  33.74 
 
 
566 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.61 
 
 
493 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  40.37 
 
 
656 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  44.76 
 
 
533 aa  205  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.02 
 
 
686 aa  206  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  40.84 
 
 
688 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
741 aa  205  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.35 
 
 
563 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.42 
 
 
688 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  41.6 
 
 
602 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  38.08 
 
 
563 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  39.84 
 
 
688 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.81 
 
 
573 aa  201  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.07 
 
 
564 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.84 
 
 
567 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  39.68 
 
 
656 aa  200  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.27 
 
 
563 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.66 
 
 
655 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1510  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.56 
 
 
574 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00534894  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.95 
 
 
561 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.56 
 
 
566 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.05 
 
 
574 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0260271  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.06 
 
 
656 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.1 
 
 
562 aa  197  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37 
 
 
650 aa  198  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.52 
 
 
689 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.22 
 
 
675 aa  197  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.38 
 
 
563 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.8 
 
 
730 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  39.52 
 
 
676 aa  195  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  34.75 
 
 
563 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
554 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.28 
 
 
560 aa  194  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0163835  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.57 
 
 
561 aa  193  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  41.98 
 
 
608 aa  194  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.99 
 
 
563 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.09 
 
 
562 aa  193  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0281709  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  40.7 
 
 
565 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.94 
 
 
689 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.71 
 
 
730 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>