More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3070 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 263 aa  525  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  58.96 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  55.65 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  52.26 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  48.41 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  46.72 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  42.98 
 
 		 261 aa  201  8e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  31.06 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  29.34 
 
 		 243 aa  99  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  31.38 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  30.29 
 
 		 243 aa  95.5  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  29.29 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  27.08 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  29.51 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  33.2 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  34.98 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  34.98 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  34.98 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  28.98 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  34.98 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  34.98 
 
 		 260 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  34.98 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  30.53 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  28.57 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  34.98 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  34.55 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  32.52 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  33.33 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  33.33 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  29.1 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  25.94 
 
 		 249 aa  85.9  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  28.75 
 
 		 232 aa  85.9  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  24.52 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  32.92 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  32.51 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  30.83 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  32.1 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  25.6 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  31.05 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  28.17 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  33.2 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  27.16 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  28.57 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  31.4 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  29.08 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  30.99 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  28.63 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  22.13 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  21.74 
 
 		 253 aa  72  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  24.9 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  24.9 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  28.45 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  25.32 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1250  nucleotidyl transferase  28.51 
 
 		 608 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  36.29 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  20.4 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  27.86 
 
 		 393 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  24.73 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  28.51 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  33.64 
 
 		 522 aa  64.3  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0016  transferase, putative  30 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  37.19 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2028  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase-like protein  28.99 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  25.87 
 
 		 564 aa  62.4  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  22.57 
 
 		 253 aa  62  0.000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  27.17 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  23.77 
 
 		 630 aa  60.8  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  38.46 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.75 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  27.66 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  31.36 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  37.84 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  30.25 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  26.45 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1377  putative UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.99 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1992  aminoglycoside phosphotransferase  25.28 
 
 		 581 aa  59.3  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.775829  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  30.25 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  30.23 
 
 		 401 aa  58.9  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  30.17 
 
 		 619 aa  58.2  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  29.77 
 
 		 568 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  35.25 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1857  nucleotidyl transferase  46.55 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.58805 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  25.38 
 
 		 596 aa  57.4  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.18 
 
 		 561 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.48 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  28.24 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3958  nucleotidyl transferase  50.75 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3308  nucleotidyl transferase  50.75 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4442  Nucleotidyl transferase  35.38 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.07 
 
 		 562 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  27.13 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.18 
 
 		 561 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0218  nucleotidyl transferase  31.21 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0125725 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.71 
 
 		 397 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  26.18 
 
 		 561 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.75 
 
 		 561 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  28.24 
 
 		 325 aa  57  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.75 
 
 		 561 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>