More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1992 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1992  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
581 aa  1204    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.775829  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0532  aminoglycoside phosphotransferase  36.74 
 
 
360 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824059  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0531  nucleotidyl transferase  43.72 
 
 
324 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3938  nucleotidyl transferase  35.42 
 
 
248 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.27 
 
 
343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  30.34 
 
 
329 aa  123  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  32.75 
 
 
348 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  36.12 
 
 
834 aa  120  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0204  nucleotidyl transferase  33.46 
 
 
311 aa  117  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  31.51 
 
 
341 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  32.62 
 
 
820 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  31.71 
 
 
346 aa  113  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  29.87 
 
 
776 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0234  Nucleotidyl transferase  33.9 
 
 
319 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2007  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  33.57 
 
 
324 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  29.07 
 
 
392 aa  110  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  31.9 
 
 
347 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  29.07 
 
 
392 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  32.16 
 
 
832 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  32.75 
 
 
843 aa  110  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  32.33 
 
 
841 aa  109  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3937  hypothetical protein  28.98 
 
 
476 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  34.53 
 
 
827 aa  110  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  28.71 
 
 
330 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  31.58 
 
 
392 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  28.63 
 
 
389 aa  108  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  27.39 
 
 
828 aa  107  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2006  hypothetical protein  31.13 
 
 
333 aa  107  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  32.44 
 
 
828 aa  107  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  32.3 
 
 
347 aa  107  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  29.75 
 
 
843 aa  107  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  28.68 
 
 
392 aa  107  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  30.87 
 
 
399 aa  107  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  31.44 
 
 
835 aa  106  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  31.72 
 
 
833 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  28.11 
 
 
835 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2761  Nucleotidyl transferase  32.57 
 
 
320 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.74 
 
 
828 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  28.75 
 
 
392 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  28.75 
 
 
392 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  32.17 
 
 
349 aa  104  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  28.24 
 
 
392 aa  103  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  31.56 
 
 
842 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0235  aminoglycoside phosphotransferase  28.85 
 
 
333 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  28.04 
 
 
381 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  28.63 
 
 
392 aa  102  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  30.13 
 
 
835 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  31.78 
 
 
828 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0327  putative nucleotidyl transferase  28.87 
 
 
381 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1919  Nucleotidyl transferase  29.88 
 
 
303 aa  100  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134563 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  30.13 
 
 
836 aa  100  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  26.76 
 
 
842 aa  99.8  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  28.07 
 
 
392 aa  99.8  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.17 
 
 
842 aa  99.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  30.13 
 
 
836 aa  99.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  31.14 
 
 
367 aa  99.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  28.22 
 
 
388 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.84 
 
 
392 aa  99.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1575  aminoglycoside phosphotransferase  27.43 
 
 
333 aa  99.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.775412  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0741  hypothetical protein  29.75 
 
 
356 aa  99  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0263  Nucleotidyl transferase  32.48 
 
 
310 aa  99  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  27.91 
 
 
388 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  27.91 
 
 
388 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  29.37 
 
 
370 aa  98.6  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0204  nucleotidyl transferase  31.84 
 
 
257 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  28.33 
 
 
392 aa  98.2  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2356  Nucleotidyl transferase  35.06 
 
 
310 aa  97.8  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  31.6 
 
 
832 aa  97.8  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.62 
 
 
836 aa  97.8  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  30.37 
 
 
392 aa  97.8  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  30.13 
 
 
361 aa  97.4  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  27.78 
 
 
841 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.46 
 
 
842 aa  97.1  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0740  hypothetical protein  26.71 
 
 
338 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  29.76 
 
 
370 aa  97.4  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3308  aminoglycoside phosphotransferase  26.25 
 
 
347 aa  97.1  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.346966  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  29.67 
 
 
821 aa  97.1  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  31.33 
 
 
370 aa  97.1  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3818  nucleotidyl transferase  31.6 
 
 
344 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0106191 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3750  Nucleotidyl transferase  29.13 
 
 
348 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11099  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  27.39 
 
 
389 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.45 
 
 
392 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07780  hypothetical protein  27.02 
 
 
338 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0103434 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  32.43 
 
 
221 aa  96.7  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  28.51 
 
 
388 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3833  Nucleotidyl transferase  29.8 
 
 
345 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.863849  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  36.05 
 
 
223 aa  96.3  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  27.24 
 
 
784 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  25.83 
 
 
340 aa  95.9  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0193  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  31.4 
 
 
315 aa  95.9  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  35.11 
 
 
230 aa  95.5  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  27.24 
 
 
784 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.27 
 
 
836 aa  95.5  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  27.63 
 
 
784 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1083  aminoglycoside phosphotransferase  25.96 
 
 
361 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0965455  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  27.98 
 
 
336 aa  95.5  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  27.63 
 
 
784 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  31.74 
 
 
241 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  30.47 
 
 
238 aa  94.7  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  28.83 
 
 
820 aa  94.4  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>