150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0532 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0532  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
360 aa  729    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824059  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1992  aminoglycoside phosphotransferase  36.74 
 
 
581 aa  186  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.775829  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  35.96 
 
 
341 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0264  aminoglycoside phosphotransferase  27.72 
 
 
334 aa  122  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.62236  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1575  aminoglycoside phosphotransferase  30.25 
 
 
333 aa  119  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.775412  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3937  hypothetical protein  32.84 
 
 
476 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3910  aminoglycoside phosphotransferase  30.26 
 
 
393 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  29.03 
 
 
329 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  28.99 
 
 
365 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0235  aminoglycoside phosphotransferase  26.97 
 
 
333 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  29.62 
 
 
340 aa  113  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  30.77 
 
 
344 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0203  aminoglycoside phosphotransferase  30.53 
 
 
335 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  28.28 
 
 
348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  26.77 
 
 
341 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  29.76 
 
 
325 aa  109  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  28.67 
 
 
330 aa  109  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1018  aminoglycoside phosphotransferase  28.93 
 
 
334 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.264433  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0741  hypothetical protein  27.7 
 
 
356 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1699  aminoglycoside phosphotransferase  32.56 
 
 
312 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  hitchhiker  0.00000021622 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2760  aminoglycoside phosphotransferase  31.21 
 
 
334 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3308  aminoglycoside phosphotransferase  30.17 
 
 
347 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.346966  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  26.4 
 
 
340 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2006  hypothetical protein  29.18 
 
 
333 aa  107  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1050  aminoglycoside phosphotransferase  30.07 
 
 
361 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00944447  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2355  aminoglycoside phosphotransferase  29.33 
 
 
358 aa  106  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0981  aminoglycoside phosphotransferase  30.41 
 
 
361 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125929  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1871  aminoglycoside phosphotransferase  26.84 
 
 
333 aa  105  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1083  aminoglycoside phosphotransferase  30.17 
 
 
361 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0965455  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0909  aminoglycoside phosphotransferase  30.3 
 
 
363 aa  105  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179002  normal  0.193933 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3111  aminoglycoside phosphotransferase  29.38 
 
 
363 aa  105  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.034337  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3205  aminoglycoside phosphotransferase  30.3 
 
 
363 aa  105  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00746028  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  28.74 
 
 
344 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  28.87 
 
 
325 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  29.63 
 
 
327 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0883  aminoglycoside phosphotransferase  30.4 
 
 
345 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858674  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2843  aminoglycoside phosphotransferase  27.53 
 
 
332 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  29.31 
 
 
340 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  28.16 
 
 
336 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2884  aminoglycoside phosphotransferase  27.09 
 
 
379 aa  102  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  26.19 
 
 
341 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  28.18 
 
 
334 aa  102  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  27.53 
 
 
362 aa  102  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0993  aminoglycoside phosphotransferase  28.12 
 
 
359 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3762  aminoglycoside phosphotransferase  30.91 
 
 
348 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3845  aminoglycoside phosphotransferase  31.1 
 
 
348 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0160  aminoglycoside phosphotransferase  28.48 
 
 
323 aa  100  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.549928 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0866  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 
348 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000878468  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2072  aminoglycoside phosphotransferase  26.43 
 
 
312 aa  99.4  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3705  aminoglycoside phosphotransferase  31.4 
 
 
348 aa  99.4  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0574  hypothetical protein  28.02 
 
 
401 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389503  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6036  aminoglycoside phosphotransferase  31.14 
 
 
427 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0395  aminoglycoside phosphotransferase  27.87 
 
 
348 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410154  normal  0.0724183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07780  hypothetical protein  29.41 
 
 
338 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0103434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2677  aminoglycoside phosphotransferase  31.99 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  28.26 
 
 
384 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000733825 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3847  aminoglycoside phosphotransferase  31.29 
 
 
347 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.899944  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  28.17 
 
 
352 aa  97.1  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  28.95 
 
 
333 aa  97.1  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0587  aminoglycoside phosphotransferase  27.09 
 
 
348 aa  97.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  29.47 
 
 
341 aa  96.7  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0192  hypothetical protein  26.8 
 
 
344 aa  95.5  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2100  aminoglycoside phosphotransferase  28.52 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2712  aminoglycoside phosphotransferase  28.52 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3635  phosphotransferase  28.62 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  30.55 
 
 
358 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  29.63 
 
 
360 aa  94.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2630  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280943  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2148  aminoglycoside phosphotransferase  27.68 
 
 
331 aa  94.4  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4063  aminoglycoside phosphotransferase  30.15 
 
 
308 aa  94  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2739  aminoglycoside phosphotransferase  28.2 
 
 
349 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  29.94 
 
 
350 aa  94  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  31.03 
 
 
323 aa  93.6  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6039  aminoglycoside phosphotransferase  27.95 
 
 
349 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2764  aminoglycoside phosphotransferase  28.62 
 
 
349 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0390  aminoglycoside phosphotransferase  27.4 
 
 
357 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0405  aminoglycoside phosphotransferase  27.12 
 
 
357 aa  93.2  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  25.15 
 
 
340 aa  92.8  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  29.43 
 
 
338 aa  92.8  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2954  aminoglycoside phosphotransferase  28.62 
 
 
342 aa  93.2  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290607  normal  0.0281748 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2815  phosphotransferase  29.93 
 
 
348 aa  92.8  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.198532  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  28.48 
 
 
346 aa  92.8  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  24.22 
 
 
339 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4077  aminoglycoside phosphotransferase  28.72 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349729  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  25.87 
 
 
339 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0740  hypothetical protein  27.78 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  30.31 
 
 
507 aa  91.3  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3511  aminoglycoside phosphotransferase  31.21 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5276  aminoglycoside phosphotransferase  26.19 
 
 
391 aa  91.3  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  24.69 
 
 
339 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  29.49 
 
 
328 aa  90.1  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0870  phosphotransferase domain-containing protein  26.24 
 
 
401 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1715  hypothetical protein  28.94 
 
 
368 aa  89.7  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0351551  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0691  phosphotransferase family protein  26.9 
 
 
344 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4765  aminoglycoside phosphotransferase  29.45 
 
 
372 aa  89.7  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.476513  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  27.99 
 
 
379 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3033  phosphotransferase, putative  30.48 
 
 
342 aa  88.6  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4025  hypothetical protein  26.29 
 
 
363 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2642  aminoglycoside phosphotransferase  30.48 
 
 
342 aa  88.6  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.365504  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1645  aminoglycoside phosphotransferase  28.62 
 
 
368 aa  88.6  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.260839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>