More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0918 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 815 aa  1619    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  40.79 
 
 		 909 aa  518  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  41.03 
 
 		 906 aa  511  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  39.78 
 
 		 904 aa  488  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.77 
 
 		 950 aa  485  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.91 
 
 		 951 aa  479  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  37.37 
 
 		 863 aa  481  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.46 
 
 		 933 aa  476  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  36.27 
 
 		 877 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.53 
 
 		 917 aa  469  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  53.17 
 
 		 918 aa  463  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.74 
 
 		 996 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  51.3 
 
 		 935 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  51.82 
 
 		 952 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.25 
 
 		 950 aa  455  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.4 
 
 		 922 aa  451  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.27 
 
 		 929 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  49.3 
 
 		 936 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.53 
 
 		 919 aa  441  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  50.63 
 
 		 918 aa  439  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.63 
 
 		 918 aa  439  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  51.05 
 
 		 916 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.63 
 
 		 918 aa  439  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.8 
 
 		 931 aa  436  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  50.7 
 
 		 972 aa  436  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50 
 
 		 921 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.31 
 
 		 981 aa  432  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  47.78 
 
 		 947 aa  430  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  50.21 
 
 		 906 aa  430  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.8 
 
 		 984 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.39 
 
 		 964 aa  428  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.31 
 
 		 951 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.71 
 
 		 932 aa  422  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  46.02 
 
 		 940 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  46.8 
 
 		 953 aa  412  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  43.38 
 
 		 889 aa  352  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  43.29 
 
 		 893 aa  350  6e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  37.03 
 
 		 905 aa  342  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  40.76 
 
 		 890 aa  340  5e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  35.46 
 
 		 1003 aa  340  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  40.76 
 
 		 924 aa  335  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  39.73 
 
 		 1055 aa  332  1e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  37 
 
 		 908 aa  332  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  40.17 
 
 		 927 aa  332  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.96 
 
 		 927 aa  330  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  40.48 
 
 		 919 aa  330  7e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  36.93 
 
 		 908 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  38.89 
 
 		 908 aa  328  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  39.96 
 
 		 924 aa  326  9e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  40.97 
 
 		 926 aa  325  1e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  36.29 
 
 		 908 aa  323  6e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  40.5 
 
 		 924 aa  322  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.34 
 
 		 952 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  39.63 
 
 		 1068 aa  305  2.0000000000000002e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  34.8 
 
 		 1073 aa  298  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  36.73 
 
 		 998 aa  296  9e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  35.5 
 
 		 1068 aa  295  2e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  37.8 
 
 		 872 aa  289  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  38.27 
 
 		 933 aa  290  1e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.07 
 
 		 762 aa  282  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.89 
 
 		 709 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  51.99 
 
 		 1026 aa  248  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.85 
 
 		 843 aa  246  9e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.17 
 
 		 990 aa  233  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  48.67 
 
 		 994 aa  231  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  48.18 
 
 		 961 aa  230  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  33.83 
 
 		 842 aa  221  6e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.63 
 
 		 817 aa  220  8.999999999999998e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.46 
 
 		 827 aa  211  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 		 847 aa  210  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.76 
 
 		 861 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.76 
 
 		 861 aa  210  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.11 
 
 		 848 aa  209  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  35.19 
 
 		 861 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  34.65 
 
 		 869 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.98 
 
 		 950 aa  201  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.92 
 
 		 873 aa  200  7.999999999999999e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  36.39 
 
 		 967 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  36.39 
 
 		 967 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.67 
 
 		 835 aa  196  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.55 
 
 		 868 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.68 
 
 		 847 aa  193  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  35.66 
 
 		 885 aa  192  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  31.54 
 
 		 842 aa  192  2e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  32.91 
 
 		 853 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  32.48 
 
 		 855 aa  191  4e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.84 
 
 		 861 aa  191  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.54 
 
 		 832 aa  191  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.08 
 
 		 838 aa  191  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.85 
 
 		 1231 aa  190  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 		 837 aa  190  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0173  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.79 
 
 		 856 aa  189  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2082  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.92 
 
 		 424 aa  189  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  33.08 
 
 		 830 aa  189  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1716  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.42 
 
 		 836 aa  187  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64793  hitchhiker  0.00121267 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.09 
 
 		 832 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2334  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.49 
 
 		 870 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.52 
 
 		 852 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.52 
 
 		 852 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 		 894 aa  184  5.0000000000000004e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>