100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2216 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  100 
 
 
898 aa  1829  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  97.44 
 
 
898 aa  1726  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  97.1 
 
 
898 aa  1745  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  35.26 
 
 
826 aa  157  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  33.65 
 
 
741 aa  143  2e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  30.37 
 
 
782 aa  136  2e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  30.35 
 
 
885 aa  135  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  30.88 
 
 
809 aa  129  2e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  27.47 
 
 
725 aa  122  2e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  29.97 
 
 
729 aa  121  5e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  29.34 
 
 
720 aa  121  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  33.21 
 
 
719 aa  120  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  29.24 
 
 
727 aa  119  2e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  28.54 
 
 
945 aa  118  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  28.75 
 
 
731 aa  115  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  28.68 
 
 
724 aa  114  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  7.33685e-05  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  28.15 
 
 
731 aa  114  1e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.84393e-06  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  28.54 
 
 
735 aa  112  4e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  27.21 
 
 
936 aa  111  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  27.45 
 
 
722 aa  108  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  27.92 
 
 
724 aa  108  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  27.93 
 
 
730 aa  108  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  29.66 
 
 
731 aa  107  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  27.93 
 
 
730 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.52412e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  30.62 
 
 
893 aa  105  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  27.68 
 
 
730 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.96014e-05  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  29.4 
 
 
656 aa  105  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  27.59 
 
 
895 aa  104  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  27.94 
 
 
745 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  26.88 
 
 
745 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  25.32 
 
 
764 aa  102  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  28.74 
 
 
843 aa  101  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  8.08171e-07 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  29.28 
 
 
738 aa  101  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  26 
 
 
741 aa  99  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  4.2193e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  36.79 
 
 
761 aa  99  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  36.79 
 
 
761 aa  99  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  36.79 
 
 
764 aa  99.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  8.91097e-06 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  36.79 
 
 
764 aa  99  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  29.29 
 
 
742 aa  97.8  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  35.75 
 
 
758 aa  97.4  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  24.94 
 
 
822 aa  95.9  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  35.75 
 
 
762 aa  95.9  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  35.23 
 
 
762 aa  95.9  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  6.43351e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  35.75 
 
 
762 aa  96.3  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  7.40819e-06 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  25.83 
 
 
653 aa  95.5  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  30.07 
 
 
650 aa  95.1  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  30.07 
 
 
650 aa  95.1  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.05402e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  30.07 
 
 
650 aa  95.1  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.35795e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  27.3 
 
 
640 aa  94.7  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  30.53 
 
 
762 aa  94.7  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  26.88 
 
 
639 aa  94.7  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  27.29 
 
 
833 aa  94.7  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  26.49 
 
 
639 aa  94.4  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  27.92 
 
 
639 aa  94.4  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  27.85 
 
 
646 aa  93.6  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  29.74 
 
 
650 aa  93.6  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  7.31399e-07 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  28.93 
 
 
656 aa  92.8  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  8.37992e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  27.45 
 
 
639 aa  92  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  4.44921e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  26.38 
 
 
639 aa  91.7  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  26.43 
 
 
639 aa  91.3  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  27.69 
 
 
639 aa  90.9  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.58979e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  25.38 
 
 
639 aa  90.9  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  29.41 
 
 
650 aa  90.9  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  28.5 
 
 
742 aa  90.5  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  31.39 
 
 
671 aa  90.5  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  32.29 
 
 
765 aa  90.9  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  26.24 
 
 
655 aa  89.7  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  25.88 
 
 
639 aa  89.7  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  28.72 
 
 
742 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  27.93 
 
 
764 aa  88.6  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  33.5 
 
 
766 aa  88.2  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  26.39 
 
 
816 aa  87.4  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  26.84 
 
 
671 aa  87  1e-15  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  28.76 
 
 
650 aa  86.7  2e-15  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  28.8 
 
 
663 aa  85.9  3e-15  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.54716e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  26.16 
 
 
667 aa  85.1  5e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.045e-05  hitchhiker  6.06277e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  28.67 
 
 
716 aa  84.7  6e-15  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  27.2 
 
 
660 aa  84  1e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  24.48 
 
 
778 aa  80.1  2e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  25.93 
 
 
788 aa  80.1  2e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  25.93 
 
 
789 aa  80.1  2e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  25 
 
 
785 aa  80.1  2e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  31.05 
 
 
1111 aa  79.7  2e-13  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  31.96 
 
 
755 aa  79.7  2e-13  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  32.49 
 
 
770 aa  77.8  8e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  25.28 
 
 
788 aa  77  1e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  25.19 
 
 
789 aa  76.3  2e-12  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  27.3 
 
 
714 aa  74.7  7e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  4.68411e-07 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  27.24 
 
 
639 aa  70.9  9e-11  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  27.13 
 
 
729 aa  67.8  9e-10  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  2.80036e-08 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  26.87 
 
 
754 aa  65.1  6e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  37.04 
 
 
857 aa  57.8  1e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3353  hypothetical protein  35.23 
 
 
856 aa  55.1  6e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3279  hypothetical protein  35.9 
 
 
854 aa  54.7  7e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  29.44 
 
 
820 aa  54.3  9e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  23.77 
 
 
757 aa  52.8  3e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0409  hypothetical protein  22.91 
 
 
782 aa  52.4  4e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4161  hypothetical protein  25.51 
 
 
785 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0782432 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  26.32 
 
 
657 aa  45.8  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2907  hypothetical protein  29.2 
 
 
793 aa  44.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>