More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2053 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
271 aa  556  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  62.55 
 
 
284 aa  331  9e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  52.08 
 
 
268 aa  262  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  52.89 
 
 
264 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  49.24 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  46.04 
 
 
263 aa  229  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.33 
 
 
513 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  43.73 
 
 
501 aa  206  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  44.21 
 
 
246 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  43.1 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.1 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  43.1 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  43.1 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  43.1 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  43.1 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  43.1 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  43.1 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  40.86 
 
 
248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  40.17 
 
 
272 aa  182  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  41.81 
 
 
248 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  41.81 
 
 
248 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  41.81 
 
 
248 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  41.81 
 
 
248 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  42.57 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  43.56 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  41.38 
 
 
248 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  45.58 
 
 
257 aa  178  9e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  44.84 
 
 
248 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  44.84 
 
 
248 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  42.55 
 
 
248 aa  176  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  42.79 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  43.97 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  38.89 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  40 
 
 
247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.21 
 
 
260 aa  172  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  42.24 
 
 
247 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  43.56 
 
 
247 aa  171  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  41.78 
 
 
248 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  43.5 
 
 
247 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  43.5 
 
 
247 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.1 
 
 
493 aa  169  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  38.37 
 
 
250 aa  167  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  38.52 
 
 
244 aa  167  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  37.96 
 
 
252 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  36.82 
 
 
269 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  40.17 
 
 
250 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  42.22 
 
 
249 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.97 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  40.26 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39 
 
 
492 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  40.62 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  40.32 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  40.62 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.71 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.71 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.71 
 
 
250 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  40.37 
 
 
254 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.71 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.71 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.71 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.71 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  40.83 
 
 
254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.06 
 
 
253 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  40.18 
 
 
250 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  41.33 
 
 
281 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  37.01 
 
 
260 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  36.61 
 
 
260 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  39.43 
 
 
245 aa  159  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.6 
 
 
244 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  38.08 
 
 
278 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  35.59 
 
 
255 aa  155  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  37.69 
 
 
278 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  36.43 
 
 
285 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  42.65 
 
 
244 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  39.91 
 
 
242 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  42.65 
 
 
244 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  42.65 
 
 
244 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  42.06 
 
 
244 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0398  extracellular solute-binding protein  37.18 
 
 
257 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  42.65 
 
 
244 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.55 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0438  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  34.46 
 
 
480 aa  152  5e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.126368  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  42.06 
 
 
244 aa  152  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  42.65 
 
 
244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  39.91 
 
 
285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5123  extracellular solute-binding protein family 3  37.18 
 
 
252 aa  151  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1156  glutamine ABC transporter periplasmic protein  39.46 
 
 
248 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 
246 aa  150  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  33.86 
 
 
247 aa  150  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  36.25 
 
 
243 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 
246 aa  149  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  35.83 
 
 
255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  38.94 
 
 
283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.98 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0824  extracellular solute-binding protein  34.9 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  35.68 
 
 
246 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  36.4 
 
 
249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  37.01 
 
 
260 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.4 
 
 
251 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  35.86 
 
 
714 aa  144  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>