280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1361 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
93 aa  184  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  60.44 
 
 
91 aa  118  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1724  transcriptional regulator, XRE family  48.86 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  48.81 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0601  transcriptional regulator, XRE family  45.65 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  51.81 
 
 
93 aa  80.5  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0593  transcriptional regulator, XRE family  45.65 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0244812  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  42.7 
 
 
94 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  44.94 
 
 
94 aa  79  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  45.05 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  48.89 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  42.7 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  43.82 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 
90 aa  74.3  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  43.9 
 
 
107 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1829  transcriptional regulator, XRE family  41.86 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  42.68 
 
 
104 aa  67  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  42.68 
 
 
104 aa  67  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  42.68 
 
 
104 aa  67  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2419  transcriptional regulator, XRE family  40.23 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  43.59 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  42.7 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  38.37 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0017  transcriptional regulator, XRE family  46.25 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  42.22 
 
 
99 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  45.31 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3174  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00826056  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  44.59 
 
 
97 aa  61.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  43.08 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0723  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000669172 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2529  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000784971  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3722  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 
103 aa  57.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0676164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3588  DNA-binding protein  34.48 
 
 
103 aa  57.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4003  DNA-binding protein  34.48 
 
 
103 aa  57.8  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0807  helix-turn-helix domain-containing protein  38.64 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0099  DNA-binding protein  37.65 
 
 
95 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1462  XRE family transcriptional regulator  34.09 
 
 
104 aa  57  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1124  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.969354  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0311  transcriptional regulator  35.87 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  36.47 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1879  DNA-binding protein  35.87 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  47.54 
 
 
465 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  33.71 
 
 
94 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  33.71 
 
 
94 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4157  XRE family transcriptional regulator  35.87 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.555179  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 
108 aa  52  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  44.44 
 
 
188 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0827  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.551431  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  40.35 
 
 
206 aa  51.6  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 
94 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 
112 aa  51.2  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5139  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 
176 aa  51.2  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  38.1 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 
184 aa  50.8  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  32.95 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3280  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.843876 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  48.21 
 
 
513 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  48 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0117  putative DNA-binding protein  40 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1817  DNA-binding protein  31.46 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.252724  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1927  XRE family transcriptional regulator  31.46 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2220  DNA-binding protein  31.46 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0402427  normal  0.0285701 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15700  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  38.46 
 
 
507 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.645755  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1442  transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  44.64 
 
 
517 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1579  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 
73 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  41.94 
 
 
516 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 
97 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3276  hypothetical protein  36.36 
 
 
105 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  36.59 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 
97 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  50.94 
 
 
210 aa  47.4  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  48.15 
 
 
203 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0416  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 
229 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.387969 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  35.37 
 
 
91 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1542  hypothetical protein  38.89 
 
 
102 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 
277 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  43.4 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  43.4 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  43.4 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  47.92 
 
 
503 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  42.86 
 
 
508 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
68 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  42.86 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  42.86 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  42.86 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  36.56 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  42.86 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>