More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4443 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
391 aa  780    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  55.44 
 
 
401 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  55.35 
 
 
399 aa  437  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  51.79 
 
 
398 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  51.4 
 
 
398 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  50.6 
 
 
407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  34.87 
 
 
397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.26 
 
 
423 aa  170  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  35.58 
 
 
395 aa  169  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  26.59 
 
 
392 aa  153  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  28.08 
 
 
444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  27.04 
 
 
412 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  32.7 
 
 
416 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  29.81 
 
 
406 aa  129  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  26.43 
 
 
430 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  28.09 
 
 
389 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  26.13 
 
 
430 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  28.19 
 
 
373 aa  124  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  33.44 
 
 
404 aa  122  9e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  28.92 
 
 
373 aa  120  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  27.59 
 
 
416 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  27.96 
 
 
417 aa  116  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  25.48 
 
 
387 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  28.62 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  26.6 
 
 
419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.55 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  27.89 
 
 
392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  26.43 
 
 
391 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  27.42 
 
 
400 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  24.56 
 
 
373 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  29.62 
 
 
376 aa  106  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  26.76 
 
 
400 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  26.09 
 
 
419 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  26.28 
 
 
389 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.84 
 
 
377 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.21 
 
 
389 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  26.16 
 
 
402 aa  100  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  24.61 
 
 
412 aa  99  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0276  septum site-determining protein MinD  30.19 
 
 
271 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.4 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  29.8 
 
 
413 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  25.13 
 
 
383 aa  96.3  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2490  Septum formation inhibitor-activating ATPase- like protein  28.74 
 
 
416 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  23.15 
 
 
397 aa  93.6  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  28.62 
 
 
447 aa  93.2  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  28.62 
 
 
447 aa  93.2  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  28.14 
 
 
537 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  27.08 
 
 
397 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  24.18 
 
 
397 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  23.03 
 
 
420 aa  89.7  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  27.69 
 
 
439 aa  89.4  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2582  septum site-determining protein MinD  26.28 
 
 
269 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  26.45 
 
 
402 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  23.47 
 
 
400 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  25.97 
 
 
402 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  25.97 
 
 
402 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  25.97 
 
 
402 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.78 
 
 
414 aa  86.7  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1281  septum site-determining protein MinD  28.4 
 
 
263 aa  86.3  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0634588  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  24.76 
 
 
402 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2011  cell division inhibitor MinD  28.47 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000962296  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1546  septum site-determining protein MinD  26.71 
 
 
276 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000380987  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2336  septum site-determining protein MinD  26.39 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0379601  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2122  cell division inhibitor MinD  28.47 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00365598  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0520  septum site-determining protein MinD  28.35 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172258 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2400  cell division inhibitor MinD  28.47 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000176634  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2035  septum site-determining protein MinD  27.51 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.05 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0035  septum site-determining protein MinD  28.24 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.253423  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0013  septum site-determining protein MinD  27.2 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0346954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1325  septum site-determining protein MinD  27.59 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0012  septum site-determining protein MinD  27.2 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223944  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1283  septum site-determining protein MinD  26.74 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126659  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  29.08 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0926  septum site-determining protein MinD  27.88 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0213983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1733  septum site-determining protein MinD  26.74 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.270038 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1066  septum site-determining protein MinD (cell division inhibitor MinD)  26.28 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00857839  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2445  septum site-determining protein MinD  27.54 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000350464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2113  septum site-determining protein MinD  27.94 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000128974  normal  0.232041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3986  septum site-determining protein MinD  26.74 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346846  normal  0.384897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4042  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 
294 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0651768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0066  septum site-determining protein MinD  27.86 
 
 
271 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  21.56 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1809  septum site-determining protein MinD  25.19 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0710931  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1996  cell division inhibitor MinD  27.86 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0445  septum site-determining protein MinD  27.74 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.103592  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2185  septum site-determining protein MinD  27.44 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000542736  unclonable  0.00000174808 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2520  septum site-determining protein MinD  27.9 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147543  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0063  septum site-determining protein MinD  27.31 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166059  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  25.97 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  25.97 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0034  septum site-determining protein MinD  28.21 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3342  septum site-determining protein MinD  26.59 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1689  septum site-determining protein (cell division inhibitor)  26.55 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1688  septum site-determining protein (cell division inhibitor)  26.55 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004087  septum site-determining protein MinD  26.28 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000729512  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1939  cell division inhibitor MinD  27.74 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2370  septum site-determining protein MinD  28.69 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0304422  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2091  septum site-determining protein MinD  24.81 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  27.27 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.735693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>