More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0081 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 231 aa  464  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 226 aa  118  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  36.95 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  35.68 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  35.68 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 212 aa  108  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 218 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 232 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  33.49 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 238 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  31.84 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  39.2 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  33.18 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 222 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  36.92 
 
 		 216 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 234 aa  104  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 211 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 229 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  35.6 
 
 		 230 aa  101  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 241 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.12 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 222 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  35.21 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 235 aa  99.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 224 aa  99  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 262 aa  98.6  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 227 aa  98.6  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 222 aa  98.2  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 226 aa  98.6  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  31.61 
 
 		 214 aa  98.2  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 250 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 248 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 262 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 262 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 269 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  36.81 
 
 		 216 aa  95.9  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 230 aa  95.1  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 255 aa  94.7  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  35.71 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  31.4 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>