More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0412 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 491 aa  981    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  48.05 
 
 		 486 aa  280  5e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  46.36 
 
 		 512 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.55 
 
 		 497 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.36 
 
 		 545 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.55 
 
 		 549 aa  256  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.19 
 
 		 509 aa  256  7e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.02 
 
 		 516 aa  256  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.53 
 
 		 468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  45.57 
 
 		 390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.47 
 
 		 573 aa  250  5e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.1 
 
 		 478 aa  248  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.84 
 
 		 625 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.76 
 
 		 520 aa  244  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.61 
 
 		 504 aa  244  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  38.69 
 
 		 481 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  36.14 
 
 		 505 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.4 
 
 		 468 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.2 
 
 		 520 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5205  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.76 
 
 		 560 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0714783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.04 
 
 		 393 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.11 
 
 		 521 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  35.64 
 
 		 530 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1726  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.18 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  32.53 
 
 		 734 aa  213  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.96 
 
 		 618 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0624  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.04 
 
 		 481 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.56 
 
 		 506 aa  212  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.45 
 
 		 414 aa  210  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  42.6 
 
 		 420 aa  209  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.95 
 
 		 526 aa  206  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.01 
 
 		 480 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1037  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.92 
 
 		 732 aa  202  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4737  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.84 
 
 		 493 aa  202  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.22 
 
 		 409 aa  200  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1061  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.31 
 
 		 567 aa  199  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6814  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.48 
 
 		 1336 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4976  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.38 
 
 		 551 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.66 
 
 		 320 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1354  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.1 
 
 		 490 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0429862  normal  0.395159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1318  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.1 
 
 		 490 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.940107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1335  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.1 
 
 		 490 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962054  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.08 
 
 		 522 aa  194  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  40 
 
 		 400 aa  192  9e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6349  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.87 
 
 		 410 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.2 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4212  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.19 
 
 		 496 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.134321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.2 
 
 		 311 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.2 
 
 		 311 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1808  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.92 
 
 		 424 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  41.22 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.4 
 
 		 336 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0935  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.83 
 
 		 465 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0761113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.74 
 
 		 306 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.74 
 
 		 307 aa  184  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.01 
 
 		 407 aa  184  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06080  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.58 
 
 		 538 aa  183  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.832186  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  35.86 
 
 		 417 aa  182  8.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.62 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  38.38 
 
 		 307 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13296  CPSA-related protein  32.07 
 
 		 497 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  41.25 
 
 		 326 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13519  hypothetical protein  33.64 
 
 		 512 aa  180  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1852  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  34.2 
 
 		 676 aa  178  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.11 
 
 		 434 aa  177  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  32.05 
 
 		 684 aa  177  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6348  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.06 
 
 		 517 aa  176  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352796  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.02 
 
 		 404 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  37.97 
 
 		 619 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.81 
 
 		 379 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.52 
 
 		 643 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4513  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.76 
 
 		 699 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4600  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.76 
 
 		 699 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3228  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.24 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0471557  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4896  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.48 
 
 		 701 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  37.18 
 
 		 434 aa  171  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2383  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.35 
 
 		 389 aa  169  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0868762  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.58 
 
 		 406 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7541  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.8 
 
 		 540 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1666  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.97 
 
 		 649 aa  166  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.59 
 
 		 466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.67 
 
 		 362 aa  165  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30000  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  35.69 
 
 		 395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1296  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.02 
 
 		 414 aa  163  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7119  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.04 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5087  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.05 
 
 		 687 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1965  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.12 
 
 		 487 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000312518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3959  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.08 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  35.1 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.21 
 
 		 584 aa  159  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8771  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.16 
 
 		 547 aa  158  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6386  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.89 
 
 		 382 aa  156  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20880  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  36.23 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3844  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  36.62 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1864  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.6 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.383316  normal  0.036217 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2594  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.52 
 
 		 442 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1165  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  39.6 
 
 		 363 aa  154  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2384  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.7 
 
 		 303 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174416  hitchhiker  0.00797054 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2228  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.15 
 
 		 521 aa  153  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000756142  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06070  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.4 
 
 		 514 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.974325  normal  0.0563121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>