More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0306 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  100 
 
 
222 aa  442  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  73.11 
 
 
218 aa  330  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  73.24 
 
 
216 aa  327  1e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  71.7 
 
 
215 aa  320  1e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  71.09 
 
 
216 aa  318  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  71.09 
 
 
216 aa  315  5e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  69.81 
 
 
217 aa  310  8e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  72.3 
 
 
216 aa  309  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  68.54 
 
 
221 aa  301  5e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  68.9 
 
 
213 aa  298  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  69.86 
 
 
219 aa  296  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  69.38 
 
 
219 aa  294  9e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  66.67 
 
 
219 aa  293  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  66.51 
 
 
236 aa  293  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  66.98 
 
 
235 aa  291  4e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  66.2 
 
 
220 aa  290  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  68.4 
 
 
220 aa  287  7e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  65.09 
 
 
223 aa  286  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  63.38 
 
 
218 aa  283  2e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  68.57 
 
 
217 aa  283  2e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  67.14 
 
 
218 aa  283  2e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  62.56 
 
 
216 aa  281  7e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  63.03 
 
 
216 aa  280  8e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  63.03 
 
 
216 aa  281  8e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  65.07 
 
 
219 aa  281  8e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  62.91 
 
 
219 aa  280  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  65.38 
 
 
220 aa  279  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  64.11 
 
 
219 aa  278  6e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  64.76 
 
 
217 aa  277  7e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  64.76 
 
 
217 aa  277  7e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  64.76 
 
 
217 aa  277  7e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  63.38 
 
 
217 aa  277  8e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  64.11 
 
 
219 aa  275  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  65.4 
 
 
218 aa  275  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0688  ribosomal protein L3  62.26 
 
 
219 aa  274  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  62.56 
 
 
226 aa  273  2e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  59.81 
 
 
210 aa  258  5e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  56.73 
 
 
212 aa  246  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  56.25 
 
 
213 aa  245  4e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  56.4 
 
 
216 aa  243  2e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  58.54 
 
 
209 aa  243  2e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  2.70125e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  58.85 
 
 
210 aa  242  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  7.29954e-06 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  57.89 
 
 
210 aa  239  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  59.72 
 
 
212 aa  239  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  57.21 
 
 
209 aa  236  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  55.5 
 
 
209 aa  235  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  54.07 
 
 
210 aa  235  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  9.81122e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  55.5 
 
 
210 aa  234  9e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  7.29631e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  55.77 
 
 
209 aa  232  4e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  57.28 
 
 
206 aa  231  6e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  2.66904e-09  hitchhiker  5.67921e-07 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  53.62 
 
 
209 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  2.31855e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  52.91 
 
 
206 aa  229  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  4.02835e-07  hitchhiker  3.18342e-09 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  55.45 
 
 
211 aa  229  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.94381e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  53.14 
 
 
209 aa  229  3e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  8.24684e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  54.93 
 
 
211 aa  228  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  3.99657e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  55.22 
 
 
209 aa  227  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  5.62685e-12  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  55.02 
 
 
209 aa  225  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  3.70606e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  54.76 
 
 
211 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.51121e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  52.66 
 
 
211 aa  225  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.30884e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0398  ribosomal protein L3  51.67 
 
 
213 aa  223  1e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  54.37 
 
 
204 aa  224  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  54.37 
 
 
211 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  56.73 
 
 
207 aa  221  5e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  54.46 
 
 
213 aa  220  1e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  56.8 
 
 
218 aa  219  2e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  54.85 
 
 
206 aa  219  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  6.08869e-05  hitchhiker  2.69964e-11 
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  51.72 
 
 
205 aa  218  4e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 
217 aa  218  4e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 
208 aa  218  6e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  53.23 
 
 
211 aa  217  9e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  51.2 
 
 
211 aa  217  9e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.74639e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  53.37 
 
 
210 aa  216  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.81863e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  54.37 
 
 
209 aa  216  3e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.45621e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  54.37 
 
 
209 aa  215  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  54.37 
 
 
209 aa  215  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.9924e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  52.2 
 
 
212 aa  214  6e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  54 
 
 
213 aa  214  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  47.32 
 
 
210 aa  214  9e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  48.13 
 
 
212 aa  213  1e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  2.41734e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  56.67 
 
 
214 aa  213  2e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  6.58885e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 
209 aa  213  2e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.95061e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  48.1 
 
 
213 aa  212  3e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2619  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 
214 aa  212  3e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0132285  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  53.88 
 
 
209 aa  212  3e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  2.22247e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2229  50S ribosomal protein L3  48.06 
 
 
209 aa  211  5e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  7.90762e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 
209 aa  212  5e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  52.38 
 
 
214 aa  211  8e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  6.7151e-11  hitchhiker  1.66028e-07 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  52.48 
 
 
209 aa  211  8e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.17498e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0497  50S ribosomal protein L3  50.95 
 
 
210 aa  210  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.443535  hitchhiker  4.71094e-09 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0327  50S ribosomal protein L3  50.95 
 
 
210 aa  210  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0584  50S ribosomal protein L3  54.37 
 
 
209 aa  210  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  1.83333e-10  normal  0.0735815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0283  50S ribosomal protein L3  54.37 
 
 
209 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.56273e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  53.4 
 
 
209 aa  209  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0289  50S ribosomal protein L3  48.06 
 
 
209 aa  209  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3915  50S ribosomal protein L3  54.37 
 
 
209 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.44377e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  46.19 
 
 
210 aa  209  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  53.14 
 
 
210 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  8.42867e-10  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  48.06 
 
 
218 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  53.14 
 
 
210 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  7.75669e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4544  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 
209 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  3.54089e-10  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>