More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0004 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 
371 aa  745    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  42.82 
 
 
375 aa  315  9e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  42.82 
 
 
375 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  42.82 
 
 
375 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  42.55 
 
 
375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  42.51 
 
 
373 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  42.55 
 
 
375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  42.55 
 
 
375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  42.55 
 
 
375 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  42.55 
 
 
375 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  42.55 
 
 
375 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  42.55 
 
 
375 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  42.7 
 
 
372 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  41.89 
 
 
374 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  42.06 
 
 
370 aa  299  5e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  42.06 
 
 
370 aa  299  5e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  41.46 
 
 
371 aa  298  1e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  41.94 
 
 
374 aa  297  2e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  41.44 
 
 
373 aa  296  3e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  41.18 
 
 
374 aa  293  3e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  40.16 
 
 
361 aa  292  5e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  40.16 
 
 
361 aa  292  5e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  40.05 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  39.73 
 
 
374 aa  280  2e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  42.7 
 
 
375 aa  273  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  38.27 
 
 
366 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  38.65 
 
 
359 aa  269  5.9999999999999995e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.13 
 
 
360 aa  253  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.49 
 
 
386 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  40.17 
 
 
371 aa  235  9e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.36 
 
 
376 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  37.57 
 
 
365 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  37.67 
 
 
360 aa  224  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  33.33 
 
 
362 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  38.54 
 
 
371 aa  219  8.999999999999998e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  34.59 
 
 
364 aa  215  8e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.68 
 
 
372 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  38.51 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  35.55 
 
 
369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  37.78 
 
 
365 aa  212  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  36.41 
 
 
392 aa  209  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.06 
 
 
377 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  38.7 
 
 
390 aa  207  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.03 
 
 
363 aa  205  8e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  39.56 
 
 
384 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  35.41 
 
 
365 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  36.49 
 
 
364 aa  202  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.95 
 
 
364 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  39.84 
 
 
376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  37.89 
 
 
377 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  36.39 
 
 
386 aa  196  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  38.01 
 
 
390 aa  195  9e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  34.96 
 
 
398 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  34.76 
 
 
401 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  34.75 
 
 
402 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000215476 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.05 
 
 
359 aa  191  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.16 
 
 
382 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  36 
 
 
370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  38.79 
 
 
380 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  38.79 
 
 
380 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  37.53 
 
 
387 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.41 
 
 
369 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.06 
 
 
381 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  34.76 
 
 
368 aa  186  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.39 
 
 
378 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0003  DNA replication and repair protein RecF  37.23 
 
 
372 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16931  recombination protein F  38.46 
 
 
352 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.919518  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.1 
 
 
372 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.57 
 
 
374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.14 
 
 
365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00030  DNA replication and repair protein RecF  36 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0042  DNA replication and repair protein RecF  26.68 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  34.94 
 
 
390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  35.22 
 
 
414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.39 
 
 
372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.33 
 
 
380 aa  184  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0004  DNA replication and repair protein RecF  40.87 
 
 
379 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.59 
 
 
362 aa  182  9.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2450  DNA replication and repair protein RecF  37.06 
 
 
366 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  37.82 
 
 
371 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0398  recF protein  32.11 
 
 
364 aa  178  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.14 
 
 
401 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0234523  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0003  DNA replication and repair protein  35.04 
 
 
363 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0241212  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  34.84 
 
 
390 aa  177  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  34.96 
 
 
394 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  36.09 
 
 
401 aa  177  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  36.97 
 
 
377 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.37 
 
 
415 aa  176  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  37.77 
 
 
371 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  32.76 
 
 
369 aa  176  7e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1145  recombination protein F  34.34 
 
 
348 aa  176  8e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  33.42 
 
 
387 aa  176  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20191  recombination protein F  34.34 
 
 
348 aa  175  9e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.99 
 
 
353 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0004  recombination protein F  36.97 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366352  unclonable  0.0000000175389 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.07 
 
 
370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0004  recombination protein F  34.67 
 
 
420 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  38.11 
 
 
377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.16 
 
 
397 aa  172  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0004  recombination protein F  35.26 
 
 
399 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000897119  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>