More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0875 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0875  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  709    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4503  hypothetical protein  83.77 
 
 		 339 aa  540  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3883  hypothetical protein  81.03 
 
 		 328 aa  537  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0436516  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3156  hypothetical protein  81.03 
 
 		 328 aa  537  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.368147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0533  hypothetical protein  76.08 
 
 		 344 aa  534  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0548  hypothetical protein  62.62 
 
 		 334 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  38.81 
 
 		 344 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.19 
 
 		 345 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  40.19 
 
 		 320 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.19 
 
 		 345 aa  245  8e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  39.55 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.06 
 
 		 325 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.06 
 
 		 327 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  39.52 
 
 		 334 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  38.64 
 
 		 356 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.02 
 
 		 336 aa  242  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.11 
 
 		 339 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.61 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  40.13 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41.91 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.27 
 
 		 330 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.58 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.07 
 
 		 328 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.2 
 
 		 339 aa  235  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  39.88 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  38.36 
 
 		 360 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  39.74 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  37.95 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.21 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.31 
 
 		 333 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  37.35 
 
 		 336 aa  232  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  38.91 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  40.4 
 
 		 324 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  37.5 
 
 		 343 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.61 
 
 		 353 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  39.6 
 
 		 328 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.62 
 
 		 328 aa  228  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.27 
 
 		 331 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.62 
 
 		 328 aa  228  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  38.08 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.69 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  39.55 
 
 		 333 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  38.04 
 
 		 341 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  37.01 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  38.89 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  39.31 
 
 		 325 aa  225  7e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.23 
 
 		 325 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  38.58 
 
 		 332 aa  225  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  37.42 
 
 		 339 aa  225  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  39.02 
 
 		 328 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  36.81 
 
 		 335 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  37.83 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  38.8 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  37.83 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  39.44 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  37.95 
 
 		 356 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.64 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  39.58 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.5 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  37.27 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  38.41 
 
 		 304 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  40.26 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  37.62 
 
 		 330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  37.62 
 
 		 330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  37.63 
 
 		 335 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  37.27 
 
 		 332 aa  222  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  39.09 
 
 		 334 aa  222  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  37.07 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  38.28 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  35.58 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.51 
 
 		 327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  35.45 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  38.74 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  35.45 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  37.95 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  34.53 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  36.97 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  38.56 
 
 		 320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  38.89 
 
 		 331 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  36.75 
 
 		 330 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  38.36 
 
 		 327 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  37.27 
 
 		 328 aa  218  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  35.92 
 
 		 335 aa  219  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  38.08 
 
 		 322 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  36.73 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2118  hypothetical protein  39.75 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0299117  normal  0.0185863 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5386  hypothetical protein  39.2 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  38.14 
 
 		 339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  34.84 
 
 		 325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0125  hypothetical protein  38.8 
 
 		 324 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.8 
 
 		 349 aa  216  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1162  hypothetical protein  34.88 
 
 		 330 aa  216  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  37.5 
 
 		 323 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  38.94 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  38.66 
 
 		 330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  35.95 
 
 		 327 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  36.96 
 
 		 330 aa  215  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  37.27 
 
 		 328 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  37.09 
 
 		 344 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3059  hypothetical protein  36.02 
 
 		 329 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.0348816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>