111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02411 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02411  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  31.85 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  38.68 
 
 		 166 aa  67  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  30.95 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  45.45 
 
 		 173 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  46.67 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  43.55 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  45.16 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  38.36 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  39.39 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  37.33 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  43.55 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  43.55 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  36.67 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  43.55 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  42.86 
 
 		 169 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  36.67 
 
 		 169 aa  60.1  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  44.44 
 
 		 157 aa  60.1  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  41.94 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  34.29 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  41.94 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  40.32 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  42.86 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  43.33 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  41.94 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  38.16 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  40.32 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  40 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  39.66 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  39.66 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  41.27 
 
 		 178 aa  57  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  41.94 
 
 		 173 aa  57  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  44.26 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  41.94 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  29.2 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  35.29 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  39.71 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  29.06 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  37.7 
 
 		 163 aa  53.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0067  hypothetical protein  34.52 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  39.68 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003563  type II secretory pathway pseudopilin PulG  39.34 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02523  hypothetical protein  39.19 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  40.68 
 
 		 190 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1109  hypothetical protein  47.83 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  34.29 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  34.38 
 
 		 163 aa  50.8  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  34.29 
 
 		 167 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  33.8 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  34.29 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  33.67 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3308  methylation site containing protein  32.86 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  36.51 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  34.67 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2860  methylation site containing protein  38.33 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  42.31 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  45.83 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  45.83 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  45.83 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  45.83 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  37.93 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  37.93 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  37.93 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4255  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  41.18 
 
 		 176 aa  47  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  44.44 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  38 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  43.48 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  38.78 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  39.58 
 
 		 178 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01338  hypothetical protein  29.58 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  42 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  30.16 
 
 		 212 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  23.36 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  37.5 
 
 		 229 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  30.88 
 
 		 218 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  36.67 
 
 		 193 aa  43.5  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  40.91 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  43.9 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3099  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  33.85 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  32.81 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2521  hypothetical protein  36.21 
 
 		 193 aa  42.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3230  methylation site containing protein  34.21 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  51.35 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  33.33 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  31.82 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1451  methylation site containing protein  39.06 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00256419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  35.29 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  28.79 
 
 		 205 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  28.79 
 
 		 205 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3316  methylation site containing protein  41.3 
 
 		 177 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192216  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  29.69 
 
 		 202 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0582  hypothetical protein  39.66 
 
 		 174 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  28.79 
 
 		 205 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0391  hypothetical protein  43.18 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.588550000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  28.79 
 
 		 201 aa  41.2  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  28.79 
 
 		 205 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  29.23 
 
 		 205 aa  41.2  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  28.79 
 
 		 205 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>