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for query gene VIBHAR_00416 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00416  inner membrane transport protein YdhC  100 
 
 		 401 aa  802    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_002035  multidrug resistance protein  90.02 
 
 		 401 aa  718    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2531  inner membrane transport protein YdhC  81 
 
 		 400 aa  609  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2062  inner membrane transport protein YdhC  46.08 
 
 		 423 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0300208  hitchhiker  0.0000445081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1975  inner membrane transport protein YdhC  45.84 
 
 		 423 aa  331  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00432346  normal  0.238152 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2001  inner membrane transport protein YdhC  45.59 
 
 		 423 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.330416  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0922  inner membrane transport protein YdhC  46.91 
 
 		 427 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2471  inner membrane transport protein YdhC  47.55 
 
 		 419 aa  323  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000730777  hitchhiker  0.00484475 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2113  inner membrane transport protein YdhC  46.32 
 
 		 414 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0214399  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2373  inner membrane transport protein YdhC  44.96 
 
 		 423 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2138  inner membrane transport protein YdhC  47.76 
 
 		 446 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.030791  normal  0.0211298 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1999  inner membrane transport protein YdhC  45.48 
 
 		 424 aa  305  7e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00228821  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2168  inner membrane transport protein YdhC  45.52 
 
 		 423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00660024  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2311  inner membrane transport protein YdhC  45.52 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0216874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2203  inner membrane transport protein YdhC  45.52 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00024069  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2203  inner membrane transport protein YdhC  45.52 
 
 		 423 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000782097  normal  0.105834 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01631  predicted transporter  45.51 
 
 		 403 aa  293  5e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1874  inner membrane transport protein YdhC  45.51 
 
 		 403 aa  293  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1740  inner membrane transport protein YdhC  45.51 
 
 		 403 aa  293  5e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.41176e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1969  inner membrane transport protein YdhC  45.51 
 
 		 403 aa  293  5e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01620  hypothetical protein  45.51 
 
 		 403 aa  293  5e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1537  inner membrane transport protein YdhC  45.51 
 
 		 403 aa  293  5e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0900835  normal  0.0201427 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2373  inner membrane transport protein YdhC  45.51 
 
 		 403 aa  292  6e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00231291  normal  0.112493 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1980  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.22 
 
 		 403 aa  290  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00451664  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1858  inner membrane transport protein YdhC  45.22 
 
 		 403 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000141458  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B1746  inner membrane transport protein YdhC  44.66 
 
 		 401 aa  288  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000953992  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1561  inner membrane transport protein YdhC  44.38 
 
 		 401 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00165154  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1524  inner membrane transport protein YdhC  44.38 
 
 		 401 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1915  inner membrane transport protein YdhC  44.38 
 
 		 401 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.04399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2012  inner membrane transport protein YdhC  45.15 
 
 		 430 aa  286  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000383533  normal  0.0277688 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1538  inner membrane transport protein YdhC  44.38 
 
 		 401 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0173263  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_1787  inner membrane transport protein YdhC  40.7 
 
 		 399 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0113984 
 
 
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NC_008700  Sama_1784  inner membrane transport protein YdhC  42.53 
 
 		 433 aa  279  5e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1753  inner membrane transport protein YdhC  44.26 
 
 		 400 aa  279  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000133845  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1859  inner membrane transport protein YdhC  44.26 
 
 		 400 aa  279  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.422452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2574  inner membrane transport protein YdhC  43.99 
 
 		 400 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.723156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2193  inner membrane transport protein YdhC  42.33 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.230534  hitchhiker  0.00000667038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.52 
 
 		 401 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.72 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  32.34 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  32.34 
 
 		 392 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  30.53 
 
 		 393 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.53 
 
 		 393 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.53 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.53 
 
 		 393 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  28.8 
 
 		 398 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.85 
 
 		 405 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.52 
 
 		 409 aa  142  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.29 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.51 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.46 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.76 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  31.12 
 
 		 392 aa  140  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.43 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.84 
 
 		 409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  28.23 
 
 		 420 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.69 
 
 		 394 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  26.46 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.47 
 
 		 410 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.43 
 
 		 394 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.06 
 
 		 424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.42 
 
 		 392 aa  127  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2800  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.84 
 
 		 411 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0413  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.09 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.01 
 
 		 416 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  27.6 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  31.82 
 
 		 404 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.42 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.18 
 
 		 407 aa  121  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.49 
 
 		 414 aa  121  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 394 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.69 
 
 		 425 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598733  normal  0.403775 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.21 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.21 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.05 
 
 		 411 aa  120  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5245  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.69 
 
 		 425 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  31.58 
 
 		 402 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5333  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.69 
 
 		 425 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.03 
 
 		 498 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  28.57 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.17 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  27.32 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.49 
 
 		 412 aa  116  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.21 
 
 		 409 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_013132  Cpin_0109  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.63 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.22 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  31.97 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3862  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.87 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.984629 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.81 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_3944  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.57 
 
 		 401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.77 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.81 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
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NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  28.1 
 
 		 409 aa  113  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.78 
 
 		 411 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.81 
 
 		 434 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  27.08 
 
 		 409 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  30.57 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.49 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.8 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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