More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2311 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2203  inner membrane transport protein YdhC  99.53 
 
 
423 aa  843    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00024069  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2373  inner membrane transport protein YdhC  84.16 
 
 
423 aa  711    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1999  inner membrane transport protein YdhC  93.87 
 
 
424 aa  775    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00228821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2203  inner membrane transport protein YdhC  99.53 
 
 
423 aa  843    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000782097  normal  0.105834 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1975  inner membrane transport protein YdhC  83.69 
 
 
423 aa  722    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00432346  normal  0.238152 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2311  inner membrane transport protein YdhC  100 
 
 
423 aa  849    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0216874  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2001  inner membrane transport protein YdhC  83.69 
 
 
423 aa  722    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.330416  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2168  inner membrane transport protein YdhC  99.53 
 
 
423 aa  845    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00660024  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2062  inner membrane transport protein YdhC  84.16 
 
 
423 aa  725    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0300208  hitchhiker  0.0000445081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2471  inner membrane transport protein YdhC  68.12 
 
 
419 aa  567  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000730777  hitchhiker  0.00484475 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0922  inner membrane transport protein YdhC  70.36 
 
 
427 aa  555  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2113  inner membrane transport protein YdhC  65.38 
 
 
414 aa  537  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0214399  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2138  inner membrane transport protein YdhC  64.89 
 
 
446 aa  533  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.030791  normal  0.0211298 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2012  inner membrane transport protein YdhC  61.9 
 
 
430 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000383533  normal  0.0277688 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1784  inner membrane transport protein YdhC  48.69 
 
 
433 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002035  multidrug resistance protein  46.08 
 
 
401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00416  inner membrane transport protein YdhC  45.52 
 
 
401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2531  inner membrane transport protein YdhC  45.85 
 
 
400 aa  291  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01631  predicted transporter  43.04 
 
 
403 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2373  inner membrane transport protein YdhC  43.12 
 
 
403 aa  288  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00231291  normal  0.112493 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1740  inner membrane transport protein YdhC  43.04 
 
 
403 aa  287  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.41176e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1969  inner membrane transport protein YdhC  43.04 
 
 
403 aa  287  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1874  inner membrane transport protein YdhC  43.04 
 
 
403 aa  287  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136238  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1915  inner membrane transport protein YdhC  44.18 
 
 
401 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.04399  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1524  inner membrane transport protein YdhC  44.18 
 
 
401 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1561  inner membrane transport protein YdhC  44.18 
 
 
401 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00165154  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01620  hypothetical protein  43.04 
 
 
403 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1980  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  43.04 
 
 
403 aa  286  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00451664  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1858  inner membrane transport protein YdhC  43.04 
 
 
403 aa  286  4e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000141458  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1537  inner membrane transport protein YdhC  43.04 
 
 
403 aa  286  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0900835  normal  0.0201427 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1538  inner membrane transport protein YdhC  44.18 
 
 
401 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0173263  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1746  inner membrane transport protein YdhC  43.92 
 
 
401 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000953992  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1753  inner membrane transport protein YdhC  41.85 
 
 
400 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000133845  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1859  inner membrane transport protein YdhC  41.85 
 
 
400 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.422452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2574  inner membrane transport protein YdhC  41.85 
 
 
400 aa  281  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.723156  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1787  inner membrane transport protein YdhC  43.02 
 
 
399 aa  277  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0113984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2193  inner membrane transport protein YdhC  41.97 
 
 
402 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.230534  hitchhiker  0.00000667038 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  29.03 
 
 
426 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.11 
 
 
392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.87 
 
 
401 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  31.44 
 
 
392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  31.44 
 
 
392 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.78 
 
 
405 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.25 
 
 
393 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.59 
 
 
412 aa  145  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.38 
 
 
405 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.99 
 
 
414 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.23 
 
 
412 aa  144  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.63 
 
 
409 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.3 
 
 
434 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.03 
 
 
405 aa  143  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.35 
 
 
405 aa  143  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.67 
 
 
411 aa  142  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.17 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.17 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  27.93 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.23 
 
 
458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.15 
 
 
413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.21 
 
 
406 aa  140  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  29.31 
 
 
398 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.46 
 
 
398 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.75 
 
 
399 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.91 
 
 
403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.5 
 
 
498 aa  137  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.33 
 
 
418 aa  137  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.05 
 
 
416 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.62 
 
 
411 aa  136  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.09 
 
 
393 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  29.5 
 
 
393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.82 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.12 
 
 
411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.5 
 
 
393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.95 
 
 
412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.07 
 
 
424 aa  133  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  33.98 
 
 
411 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.98 
 
 
411 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.36 
 
 
410 aa  133  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.98 
 
 
400 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.98 
 
 
400 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.98 
 
 
411 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.98 
 
 
400 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.98 
 
 
400 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.81 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  27.86 
 
 
426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  31.34 
 
 
414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.68 
 
 
406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.46 
 
 
400 aa  130  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_014210  Ndas_2399  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.44 
 
 
457 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.35739 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.64 
 
 
403 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.88 
 
 
398 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.04 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.638949 
 
 
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NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.21 
 
 
440 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_4120  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.38 
 
 
411 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.17 
 
 
409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.29 
 
 
399 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.33 
 
 
420 aa  127  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.38 
 
 
411 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.85 
 
 
400 aa  127  5e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  29.74 
 
 
392 aa  126  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.35 
 
 
437 aa  126  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
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