179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001606 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001606  putative two-component response regulatory protein  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05586  hypothetical protein  99.48 
 
 		 193 aa  394  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0829  response regulator receiver:ANTAR  40.62 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018256 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2821  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  46.38 
 
 		 224 aa  72  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.41961  normal  0.477248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2506  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.76 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5900  two component response regulator  36.59 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  40 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.62 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  31.9 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4528  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.59 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1611  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.35 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101988 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2093  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.35 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal  0.0833699 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1211  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.71 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4139  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.24 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214536 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3647  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.35 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1604  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.35 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3741  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.93 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2314  response regulator  32.43 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2394  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.41 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00108275  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2302  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.24 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.874561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2306  response regulator NasT  41.18 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1784  response regulator receiver  41.18 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2871  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.71 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372726  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2581  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.35 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.298585  hitchhiker  0.00648362 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  32.52 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1632  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.15 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0623893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2104  response regulator receiver:ANTAR  41.18 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4455  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.93 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.269789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1455  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.93 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4227  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.24 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  31.86 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4961  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.71 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.044252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5014  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.71 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3038  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.37 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4498  ANTAR domain-containing protein  31.71 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23450  response regulator NasT  41.18 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.212044  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2177  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.93 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.13 
 
 		 421 aa  57.8  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.84 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2529  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.44 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1448  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.53 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41490  hypothetical protein  40 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.84 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.84 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  30.08 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3519  hypothetical protein  40 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1086  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.53 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  32.5 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1762  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.29 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48447  normal  0.0125916 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12950  response regulator with putative antiterminator output domain  32.74 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.22629  normal  0.269406 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1661  transcription antitermination regulatory protein  32.93 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5687  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.2 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3275  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 		 430 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.86 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  32.74 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0888  response regulator  30.77 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.85 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3317  putative response regulator NasT  38.81 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0234612  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0331  response regulator receiver:ANTAR  38.57 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.43 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.88 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3459  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.9 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.84 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3775  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  33.63 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.665226  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.84 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.73 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3525  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.84 
 
 		 433 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0678  response regulator receiver and ANTAR domain protein  23.44 
 
 		 243 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0769  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.65 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0679202  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.32 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1262  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.21 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1081  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.27 
 
 		 247 aa  53.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2830  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.93 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2675  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.29 
 
 		 383 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2864  Fis family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561884  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2319  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.93 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.5 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.33 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30 
 
 		 464 aa  52.8  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0963  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.91 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000231614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1890  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.94 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0366782  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0664  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.78 
 
 		 441 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.293281  normal  0.015345 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  27.59 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1146  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.43 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2959  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.46 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.793007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.95 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2508  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.33 
 
 		 427 aa  52.4  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102211  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1118  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.13 
 
 		 427 aa  52.4  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.41 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.45 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2149  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.25 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1393  putative response regulator transcription regulator protein  35.62 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3266  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.14 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1703  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.71 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.242071  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  33.33 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1977  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.56 
 
 		 227 aa  51.2  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>