More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0283 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0283  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
421 aa  849    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.827145  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
419 aa  308  8e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf392  histidyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.438879  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
429 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
429 aa  298  9e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
411 aa  298  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
429 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
426 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 
426 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
423 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
435 aa  293  3e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
424 aa  293  5e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 
419 aa  292  7e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
426 aa  288  9e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
423 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
424 aa  287  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 
433 aa  287  2e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1830  histidyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
433 aa  288  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
429 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
426 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
430 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 
415 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 
430 aa  280  3e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
430 aa  279  7e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
445 aa  278  1e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
424 aa  278  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 
423 aa  276  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 
423 aa  276  6e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 
423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
421 aa  271  2e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
419 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
419 aa  270  5e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl366  histidyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
457 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113949  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
421 aa  269  7e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
420 aa  269  8e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 
417 aa  268  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 
414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0136  histidyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
415 aa  266  4e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.179291 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
423 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
423 aa  266  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 
420 aa  266  5.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
423 aa  266  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
423 aa  266  7e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
423 aa  266  7e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
423 aa  266  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
426 aa  265  8e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
426 aa  265  8e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
425 aa  265  8e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
418 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12600  histidyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
423 aa  264  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0797227  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
420 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  36.84 
 
 
423 aa  264  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
420 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 
422 aa  264  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 
424 aa  264  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  38.51 
 
 
422 aa  263  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 
426 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  35.66 
 
 
417 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 
417 aa  262  8e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 
430 aa  261  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0324  histidyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
414 aa  261  1e-68  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 
422 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 
424 aa  261  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
415 aa  260  4e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
426 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 
429 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
426 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 
422 aa  259  6e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
426 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 
415 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 
428 aa  259  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
426 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 
410 aa  258  1e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 
406 aa  258  1e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2311  histidyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
421 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202906  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
423 aa  257  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 
414 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  38 
 
 
423 aa  257  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 
414 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
421 aa  256  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
429 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 
417 aa  256  6e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
424 aa  256  6e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 
417 aa  256  7e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
424 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
424 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 
424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>