255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2689 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2689  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 154 aa  295  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2700  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.58 
 
 		 165 aa  192  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5579  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  61.9 
 
 		 159 aa  177  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2987  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  62.42 
 
 		 171 aa  175  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01130  hypothetical protein  55.7 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2641  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.12 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375974  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00130  hypothetical protein  53.79 
 
 		 159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1027  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  60.29 
 
 		 167 aa  138  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278653  normal  0.0205015 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2094  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  52.48 
 
 		 174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0121  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.35 
 
 		 172 aa  124  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.433754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.8 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  37.9 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  32.5 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  30.51 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  28.46 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  28.45 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  29.03 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002487  hypothetical protein  29.32 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  31.36 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  36.72 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03547  hypothetical protein  28.57 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 		 576 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02442  ybaK/ebsC protein  29.27 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00512118  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0622  ybaK/ebsC protein  26.23 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966718  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  38.66 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  35.25 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2645  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.91 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00567301  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  36.09 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  30.1 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  33.67 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  31.62 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0161  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.71 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00528766 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1957  ybaK/ebsC protein  29.86 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000134669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  29.66 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  35.64 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  32.82 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  32.2 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1441  ybaK/ebsC protein  34.15 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1523  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.03 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0396  hypothetical protein  27.97 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1509  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.76 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.710297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0721  ybaK/ebsC protein  30.59 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0737  ybaK/ebsC protein  30.59 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02710  hypothetical protein  33.6 
 
 		 180 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0577764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0808  prolyl-tRNA synthetase  30.36 
 
 		 565 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000617993  hitchhiker  0.000236746 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 		 577 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.89 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  28.1 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  32.54 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 		 564 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2850  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.89 
 
 		 171 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0762235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  31.36 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1956  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  hitchhiker  0.00991863 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3773  ybaK/ebsC protein  28.57 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  35.04 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  26.83 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2809  ybaK/ebsC protein  30.39 
 
 		 160 aa  51.2  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  34.07 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08460  ybaK/ebsC protein  27.64 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466447  normal  0.283555 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1072  hypothetical protein  27.36 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.47969e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  31.62 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 574 aa  51.2  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3961  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.58 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  28.57 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0706  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.83 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  28.81 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  32.8 
 
 		 172 aa  50.4  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  31.78 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  22 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2581  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.635431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 		 573 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1719  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.33 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.325285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4290  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.62 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000309077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1765  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.33 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.561232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  34.23 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  25.45 
 
 		 566 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0441  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.18 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.61 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0192059  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5889  hypothetical protein  30.77 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.158473 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1376  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  21.95 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  32.41 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  27.42 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1697  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.33 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4790  ybaK/ebsC protein  30.09 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170167  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0912  ybaK/ebsC protein  26.23 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0961985  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1617  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.02 
 
 		 186 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  32.52 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  26.15 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1813  transcriptional regulator  30 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  28.21 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  35.77 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1696  ybaK/ebsC protein  29.27 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0180556 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  28.57 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3997  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.3 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.277402 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 577 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  30 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1840  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.16 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0451372  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  25.2 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0739  ybaK/ebsC protein  29.06 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451336  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>