254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0355 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  100 
 
 		 168 aa  345  2e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0737  ybaK/ebsC protein  60.51 
 
 		 160 aa  207  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0721  ybaK/ebsC protein  60.51 
 
 		 160 aa  207  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3116  transcriptional regulator  47.77 
 
 		 158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3053  ybaK/ebsC protein  47.77 
 
 		 158 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3347  ybaK/ebsC family protein  47.13 
 
 		 158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.297019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3129  ybaK/ebsC family protein  47.77 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3375  ybaK/ebsC family protein  47.77 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3350  ybaK/ebsC family protein  46.5 
 
 		 158 aa  160  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3021  transcriptional regulator  46.5 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0622  ybaK/ebsC protein  47.44 
 
 		 158 aa  160  9e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966718  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1903  ybaK/ebsC family protein  45.86 
 
 		 158 aa  160  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3328  ybaK/ebsC family protein  45.86 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3353  ybaK/ebsC family protein  45.86 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.261499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3222  ybaK/ebsC protein  48.05 
 
 		 161 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  43.48 
 
 		 169 aa  144  4.0000000000000006e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  42.86 
 
 		 157 aa  140  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1566  ybaK/ebsC protein  43.48 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0327966  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0583  ybaK/ebsC protein  45.64 
 
 		 158 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1356  ybaK/ebsC protein  45.16 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00173308  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08460  ybaK/ebsC protein  43.79 
 
 		 161 aa  134  8e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466447  normal  0.283555 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1956  ybaK/ebsC protein  45.03 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  hitchhiker  0.00991863 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  39.62 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  41.94 
 
 		 158 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  41.45 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1957  ybaK/ebsC protein  41.25 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000134669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0105  YbaK/ebsC protein  38.96 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  35.71 
 
 		 169 aa  114  7.999999999999999e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  36.13 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  37.25 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3195  ybaK/ebsC protein  39.1 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1378  YbaK/ebsC protein  37.66 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0222157  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1696  ybaK/ebsC protein  40.82 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0180556 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  34.19 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1609  ybaK/prolyl-tRNA synthetases associated domain-containing protein  48.18 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0985663  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  33.76 
 
 		 172 aa  107  6e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  35.48 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  35.03 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.48 
 
 		 159 aa  104  7e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0192059  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  38.06 
 
 		 155 aa  102  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  40.14 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  34.64 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  38.82 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  36.71 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  32.9 
 
 		 158 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  32.9 
 
 		 158 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  32.3 
 
 		 160 aa  99.8  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  36.13 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  32.28 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  33.55 
 
 		 158 aa  98.6  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  32.9 
 
 		 156 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  32.9 
 
 		 158 aa  97.8  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  34.39 
 
 		 159 aa  97.8  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  34.62 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  34.39 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  34.62 
 
 		 159 aa  97.4  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  34.39 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  34.39 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  30.63 
 
 		 155 aa  97.1  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  34.39 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  34.39 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  34.39 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  34.39 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  32.26 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  32.26 
 
 		 158 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  32.26 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  32.91 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  32.9 
 
 		 158 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  32.9 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  34.39 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  95.1  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.39 
 
 		 158 aa  94.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  32.26 
 
 		 156 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  32.26 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  32.26 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  37.41 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  32.69 
 
 		 159 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  32.69 
 
 		 159 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  32.69 
 
 		 159 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  34.19 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  32.69 
 
 		 159 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  32.69 
 
 		 159 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  36.05 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  34.42 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  31.61 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  32.24 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  32.32 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0092  ybaK/ebsC protein  35.06 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  32.89 
 
 		 156 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  30.92 
 
 		 155 aa  91.3  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  30.97 
 
 		 156 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  32.47 
 
 		 156 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  30.97 
 
 		 156 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  40.17 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1431  ybaK/ebsC protein  36.94 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4191  ybaK/ebsC protein  33.76 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0625449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  35.44 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2187  hypothetical protein  39.22 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0785  ybaK/ebsC protein  36.6 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  33.54 
 
 		 162 aa  88.6  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>