50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2850 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2850  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 171 aa  340  5.999999999999999e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0762235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8118  hypothetical protein  69.82 
 
 		 173 aa  222  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564267  normal  0.663077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4145  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  71.26 
 
 		 173 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.704606  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0591  hypothetical protein  73.72 
 
 		 180 aa  200  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0034  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.47 
 
 		 172 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.510186  normal  0.239177 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1719  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  59.52 
 
 		 177 aa  191  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.325285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1765  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  59.52 
 
 		 177 aa  191  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.561232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1697  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  59.52 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02510  hypothetical protein  57.41 
 
 		 181 aa  187  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0689687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6768  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  65 
 
 		 184 aa  184  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560351  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1840  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  60.37 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0451372  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8692  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  65.85 
 
 		 180 aa  180  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4973  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  66.18 
 
 		 183 aa  174  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02710  hypothetical protein  55.29 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0577764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4342  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.89 
 
 		 184 aa  169  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.519353 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0872  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  62.42 
 
 		 231 aa  167  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.497961  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3610  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  51.48 
 
 		 180 aa  155  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1617  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  52.66 
 
 		 186 aa  151  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2291  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  51.16 
 
 		 189 aa  143  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2044  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  49.15 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21350  hypothetical protein  49.13 
 
 		 210 aa  135  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0855056  normal  0.358987 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1438  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.55 
 
 		 188 aa  130  9e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.78222  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34850  putative tRNA synthase  44.64 
 
 		 180 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00137081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0770  hypothetical protein  40.24 
 
 		 179 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4449  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.22 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000475231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3668  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.22 
 
 		 127 aa  91.7  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.189269 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0161  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.96 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00528766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  39.19 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2689  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.89 
 
 		 154 aa  51.6  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  28.33 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1376  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.11 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1624  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.91 
 
 		 153 aa  47.4  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  28.45 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  24.26 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  27.63 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  26 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2094  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.62 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2044  YbaK/EbsC family protein  26.14 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0548  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.93 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0303  hypothetical protein  37.1 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2700  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.15 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102685 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  31.3 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2948  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.92 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  28.95 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0441  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1653  putative ybaK-like protein  28.57 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01130  hypothetical protein  38.46 
 
 		 153 aa  40.8  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  31.65 
 
 		 162 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  31.48 
 
 		 161 aa  40.4  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>