48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0591 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0591  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  356  9e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4145  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  67.8 
 
 		 173 aa  221  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.704606  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1840  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  65.54 
 
 		 182 aa  220  8e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0451372  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02510  hypothetical protein  64 
 
 		 181 aa  213  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0689687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2850  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  68.67 
 
 		 171 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0762235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6768  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  66.29 
 
 		 184 aa  210  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8118  hypothetical protein  67.88 
 
 		 173 aa  208  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564267  normal  0.663077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4342  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  60 
 
 		 184 aa  201  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.519353 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0034  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  68.48 
 
 		 172 aa  197  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.510186  normal  0.239177 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0872  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  71.83 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.497961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8692  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.95 
 
 		 180 aa  185  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3610  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.67 
 
 		 180 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1697  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  57.89 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1765  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  57.31 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.561232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1719  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  57.31 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.325285  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4973  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  61.45 
 
 		 183 aa  174  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2291  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  57.47 
 
 		 189 aa  174  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1617  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  54.02 
 
 		 186 aa  168  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02710  hypothetical protein  55.09 
 
 		 180 aa  162  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0577764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2044  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  51.93 
 
 		 190 aa  160  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21350  hypothetical protein  47.73 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0855056  normal  0.358987 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1438  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  48.02 
 
 		 188 aa  141  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.78222  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0770  hypothetical protein  43.97 
 
 		 179 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34850  putative tRNA synthase  45.39 
 
 		 180 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00137081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4449  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.36 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000475231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3668  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.86 
 
 		 127 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.189269 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0161  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.69 
 
 		 163 aa  51.6  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00528766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  38.95 
 
 		 155 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-like protein  31.96 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.702018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  25.21 
 
 		 157 aa  48.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  28.93 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2689  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.25 
 
 		 154 aa  45.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1416  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.25 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  28 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  28.16 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  32.65 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  32.65 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  32.65 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1755  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.67 
 
 		 156 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1376  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  23.53 
 
 		 154 aa  42  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2948  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.75 
 
 		 103 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2700  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.25 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102685 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 		 154 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  28.79 
 
 		 158 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  28.21 
 
 		 158 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2094  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.11 
 
 		 174 aa  41.2  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5549  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.89 
 
 		 159 aa  40.8  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  28.21 
 
 		 158 aa  40.8  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>