224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3402 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-like protein  100 
 
 		 162 aa  317  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.702018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5754  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.91 
 
 		 163 aa  114  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.036925  hitchhiker  0.00000000000572699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4341  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.87 
 
 		 173 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3880  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.87 
 
 		 176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.745877  normal  0.0848334 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1391  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  40.4 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000245761 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3920  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.31 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4448  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.74 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2011  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  40.54 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.111031  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01756  hypothetical protein  40.54 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1408  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  40.4 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.247573 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1495  hypothetical protein  37.97 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301949  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1845  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.54 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.900726  normal  0.129019 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1873  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  40.54 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1404  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  40.54 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.812752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2041  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  40.54 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1374  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  40.4 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.734452  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01744  hypothetical protein  40.54 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5859  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.11 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284913  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1855  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.54 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2511  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  40.54 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.579279 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2074  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  39.74 
 
 		 175 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1894  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  40.4 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1668  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.19 
 
 		 165 aa  104  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1821  YbaK/prolyl-tRNA synthetases associated domain-containing protein  31.15 
 
 		 191 aa  97.1  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1112  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.04 
 
 		 191 aa  86.3  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  39.18 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  34.84 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03547  hypothetical protein  27.63 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0933  hypothetical cytosolic protein  26.49 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  29.22 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002487  hypothetical protein  27.97 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190269  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3691  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.61 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  32.87 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1696  ybaK/ebsC protein  27.63 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0180556 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1441  ybaK/ebsC protein  37.82 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  29.79 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  30.97 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  31.71 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  32.74 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  28.37 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  28.37 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0303  hypothetical protein  30.97 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000014956  unclonable  0.000000628456 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  28.37 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  28.37 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  31.85 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0089  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2116  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.76 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0022261  decreased coverage  0.00203199 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  28.37 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  27.66 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  27.66 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  33.07 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2082  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.52 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.184179  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  32.29 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  25.17 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0518  hypothetical protein  29.29 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0591601  normal  0.512075 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  29.46 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.77 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  35.09 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  35.37 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3195  ybaK/ebsC protein  32.35 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  31.33 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  31.97 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4093  hypothetical protein  33.75 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.889047 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0968  hypothetical protein  25.17 
 
 		 154 aa  51.6  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.107423  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  31.63 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1134  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.03 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2486  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.62 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0591  hypothetical protein  31.96 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  31.63 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  27.45 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  31.29 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  37.37 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  35 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  28.87 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  32.5 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  30.53 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1260  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  23.81 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  24.83 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2070  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.1 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0237486  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  31 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2948  ybaK/ebsC protein  27.56 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2899  ybaK/ebsC protein  38.96 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000923134  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  29.75 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  26.49 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1756  hypothetical protein  28.39 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  27.7 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  33.75 
 
 		 187 aa  48.5  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  30.97 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0525  ybaK/ebsC protein  29.69 
 
 		 175 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  35 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  29.47 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0201  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  23.72 
 
 		 163 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  32.62 
 
 		 156 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  26.32 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34850  putative tRNA synthase  35.04 
 
 		 180 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00137081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  26.8 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  35.05 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0986  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  19.33 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.015482  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0269  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  22.92 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>