70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1873 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_01744  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  340  5e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1404  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  100 
 
 
167 aa  340  5e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.812752  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1845  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 
167 aa  340  5e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.900726  normal  0.129019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01756  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  340  5e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1873  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  100 
 
 
167 aa  340  5e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2041  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  99.4 
 
 
167 aa  338  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1855  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  99.4 
 
 
167 aa  338  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2511  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  99.4 
 
 
167 aa  338  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.579279 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2011  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  98.2 
 
 
167 aa  336  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.111031  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2074  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  88.48 
 
 
175 aa  303  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1374  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  87.88 
 
 
175 aa  302  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.734452  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1408  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain-containing protein  87.88 
 
 
175 aa  300  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.247573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1391  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  87.88 
 
 
175 aa  300  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000245761 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1894  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-associated domain protein  87.27 
 
 
175 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1668  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  83.64 
 
 
165 aa  289  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5754  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  54 
 
 
163 aa  167  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.036925  hitchhiker  0.00000000000572699 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1112  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  49.13 
 
 
191 aa  164  4e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1821  YbaK/prolyl-tRNA synthetases associated domain-containing protein  46.89 
 
 
191 aa  155  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4448  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.37 
 
 
173 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5859  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.37 
 
 
173 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284913  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3920  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.37 
 
 
174 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1495  hypothetical protein  47.37 
 
 
167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301949  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3880  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.64 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.745877  normal  0.0848334 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4341  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.39 
 
 
173 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-like protein  40.54 
 
 
162 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.702018  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3567  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.21 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0933  hypothetical cytosolic protein  25 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03547  hypothetical protein  24.38 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1929  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.45 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2082  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.41 
 
 
154 aa  50.8  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.184179  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  29.05 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002487  hypothetical protein  24.34 
 
 
148 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5075  hypothetical protein  23.81 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2116  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.49 
 
 
153 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0022261  decreased coverage  0.00203199 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4839  hypothetical protein  23.81 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0119961  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5204  hypothetical protein  23.81 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.475528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4795  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  23.75 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.075177  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2070  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.42 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0237486  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  31.86 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2174  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.51 
 
 
157 aa  49.3  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000343666 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4697  DNA-binding protein  23.81 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.397642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  31.09 
 
 
158 aa  48.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5115  hypothetical protein  23.13 
 
 
159 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109943  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0161  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.47 
 
 
163 aa  48.1  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00528766 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5108  hypothetical protein  23.13 
 
 
159 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  32.38 
 
 
157 aa  47.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3691  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  23.9 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1791  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.16 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0125  hypothetical protein  23.81 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00974203  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  27.34 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4681  DNA-binding protein  23.13 
 
 
159 aa  45.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114471  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  38.71 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1756  hypothetical protein  27.7 
 
 
152 aa  45.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002475  putative DNA-binding protein  27.01 
 
 
160 aa  45.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1431  ybaK/ebsC protein  29.84 
 
 
164 aa  45.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5113  hypothetical protein  22.45 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000743566  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1758  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25.48 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0303  hypothetical protein  26.67 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000014956  unclonable  0.000000628456 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0355  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  25.35 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1523  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  23.64 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2156  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.284719  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2486  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.85 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  30.14 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0441  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.09 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  30.14 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1212  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  20.55 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0760914  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1509  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.59 
 
 
162 aa  41.6  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.710297  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  31.73 
 
 
157 aa  41.2  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  29.52 
 
 
157 aa  41.2  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2044  YbaK/EbsC family protein  22.76 
 
 
156 aa  41.6  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>